8种植物CHI基因的生物信息学分析.pdfVIP

第 33卷 第2期 西 南 林 业 大 学 学 报 V0l_33 No．2 2013年4月 JOURNAL OF SOUTHWEST FORESTRY UNIVERSITY Apr．2013 doi：10．3969／j．issn．2095—1914．2013．02．018 8种植物 CHI基因的生物信1日一自、学分析 原晓龙 ， 周 军 ， 辛培尧 ’ 董 娇 孟富宣’， 付海辉 (1．西南林业大学林学院，云南 昆明650224；2．西南林业大学西南山地森林保育与利用省部共建教育部重点实验室，云南 昆明650224 3．中华全国供销合作总社昆明食用菌研究所，云南 昆明650223；4．复旦大学生命科学学院，上海200433) 摘要：根据 GenBank上已登录的拟南芥、苹果杂交种、草莓、桃、沙梨的栽培种美人酥、葡萄、柑橘和 玉米的查尔酮异构酶基因蛋 白质氨基酸残基序列，应用生物软件对其组成成分、导肽、信号肽、跨膜 结构域、疏水性与亲水性、蛋 白质二级和三级结构以及功能域进行预测和分析。结果表明：8种植 物的CHI不具有导肽，不存在信号肽，不具有跨膜结构，推测CHI可能定位于细胞质基质中发挥功 能，多肽链总体表现为亲水性；有仅一螺旋、$一转折、无规则卷曲和延伸链4种二级结构，除了无规 则卷曲是桃的最主要二级元件外；其余 7种植物均是 o【一螺旋为最主要的结构元件；8种植物可能 均有 1个查尔酮异构酶活性部位 。 关键词：查尔酮异构酶；生物信息学分析；蛋 白质功能预测 中图分类号：$718．46 文献标志码 ：A 文章编号：2095—1914(2013)02—0088—08 BioinformaticsAnalysisofCHIGenesinEightPlantSpecies YUANXiao．1ong'，ZHOU Jun'，XINPei—yao’，DONGJiao ，MENG Fu．xuan ，，FU Hai．hui (1．ForestryCollege，SouthwestForestryUniversity，KunmingYunnan，650224，China；2．KeyLaboratoryforForestResources ConservationandUtilizationintheSouthwestMountainousAreaofChina，SouthwestForestry University，KunmingYunnan， 650224，China；3．KunmingEdibleFungiInstituteofChinaNationalFederationofSupplyandMarketingCooporatives， KunmingYunnan，650223；4．CollegeofLifeSciences，FudanUniversity，Shanghai，200433，China) Abstract：TheresidualaminoacidsequencesofCHIofArabidopsisthaliana，PyruspyrifoliacuhivarMeiren— SU，Malushybridcultivar，Prunuspersica，Vitisvinifera，Fragaria×ananassa，Citrussinensis，Zeamayswerea- doptedfrom GeneBank．Thecomposition oftheresidualamino acid sequences，leaderpeptide，signalpeptide， trans-membranetopologicalstructure，hydrophobicity／hydrophilicity，thesecondarystructure，thetertiarysturc— tureandfunctionaldomainsoftheproteinswerepredictedandanalyzed．Theresu