基因工程工具酶资料.ppt

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核糖核酸酶---核糖核酸酶A 核糖核酸酶A(RNase A):内切核糖核酸酶,来源于牛胰脏。 切割机制:攻击RNA上嘧啶碱基的3’端。 反应条件极宽,极难失活。 低盐浓度(0-100mM): 切割单链和双链RNA; 切割DNA:RNA杂交体中的RNA。 高盐浓度(≧300mM): 特异切割单链RNA。 可被胎盘RNA酶抑制剂(RNasin)或氧钒-核糖核苷复合物(VRC)抑制。 用途: 从DNA:RNA杂交体中去除未杂交的RNA区。 确定RNA或DNA中的单碱基突变的位置。 RNA检测----核糖核酸酶保护分析法。 降解DNA制备物中的RNA分子。 核糖核酸酶---核糖核酸酶T1 核糖核酸酶T1(RNase T1):内切核糖核酸酶,来源于米曲霉。 切割机制:攻击RNA上鸟嘌呤核苷酸3’端磷酸。 反应条件极宽,极难失活。 类似于核糖核酸酶A。 核糖核酸酶---核糖核酸酶H 核糖核酸酶H(RNase H):来源于小牛胸腺组织。 特异降解DNA:RNA杂交双链中的RNA链。 用途: 与DNA聚合酶I和DNA连接酶共同参与cDNA第二条链的合成。 mRNA cDNA第一链 mRNA 反转录 RNase H 5’ 3’ 5’ 3’ dNTP DNA 聚合酶I 5’ 3’ 5’ 3’ DNA连接酶 cDNA第一链 cDNA第二链 脱氧核糖核酸酶I 脱氧核糖核酸酶I(DNase I):源于牛胰脏,一种糖蛋白,通常得到的是几种同工酶的混合物。 切割机制:从嘧啶核苷酸5’端磷酸随机降解单链或双链DNA。 Mg2+存在条件下,能在DNA双链上随机独立的产生切口。 Mn2+存在条件下,在双链DNA大致同一位置上切割产生平头端DNA 用途: 与DNA聚合酶I一起参加切口平移。 Mn2+存在下,用鸟枪法制作DNA文库,用于测序。 DNase I足迹法。 去除转录产物中的模板DNA DNase I足迹法 S1核酸酶 S1核酸酶:源于米曲霉菌,含锌蛋白质,相对耐热。 反应需要Zn2+和酸性条件(pH4.0-4.5)。 降解单链DNA或RNA 降解方式为内切或者外切 酶量过大时,伴有双链核酸的降解,活性很小。 用途: 切掉DNA片段的单链突出末端产生平头末端; 双链cDNA合成时切除发夹结构; S1核酸酶作图:测定杂交分子的杂交程度、RNA分子定位、确定内含子位置、内含子剪切位点定位、转录起始终止位点测定等。 S1核酸酶作图法 引物延伸法 2.6 核酸外切酶 分类:作用于单链;作用于双链;既可作用单链又可作用双链。 用途: 大肠杆菌核酸外切酶VII:内含子和外显子位置测定等。 大肠杆菌核酸外切酶III:与S1核酸酶联合用于大片段测序。 Bal 31核酸酶:大片段测序 2.7 T4噬菌体多核苷酸激酶 pse T基因编码,具有激酶活性和磷酸酶活性。 5’激酶活性:正向反应和交换反应。 3’磷酸酶活性 用途: DNA或RNA 5’末端标记。 用于连接反应的5’-磷酸的添加。 正向反应和交换反应 2.8 碱性磷酸酶 两类碱性磷酸酶: 细菌碱性磷酸酶(BAP)和小牛肠碱性磷酸酶(CIP)。 催化核酸分子的 5’端脱磷酸。 用途: 5’末端标记前的处理; 去除DNA片段的5’端磷酸,防止自身连接。 5’ RACE中利用CIP去除非mRNA的5’-磷酸。 利用碱性磷酸酶的5’ RACE 人有了知识,就会具备各种分析能力, 明辨是非的能力。 所以我们要勤恳读书,广泛阅读, 古人说“书中自有黄金屋。 ”通过阅读科技书籍,我们能丰富知识, 培养逻辑思维能力; 通过阅读文学作品,我们能提高文学鉴赏水平, 培养文学情趣; 通过阅读报刊,我们能增长见识,扩大自己的知识面。 有许多书籍还能培养我们的道德情操, 给我们巨大的精神力量, 鼓舞我们前进。 * 成斑率(平板效率)(efficiency of plating,EoP) * 平末端连接的技巧介绍 * 用于制备杂交探针 * 2 基因工程工具酶 2.1 限制性核酸内切酶 2.2 连接酶 2.3 DNA聚合酶 2.4 末端转移酶 2.5 核酸酶 2.6 核酸外切酶 2.7 T4噬菌体多核苷酸激酶 2.8 碱性磷酸酶 2.1 限制性核酸内切酶 E coli B E coli K λ. K λ. B EOP=1 EOP=1 EOP=10-4 EOP=1

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