生物信息学第六章蛋白质结构预测及分子设计选读.ppt

自动模式 比对模式 工程模式 SWISS-MODEL工作模式 主要参数/选项 粘贴SWISS-MODEL.txt中的蛋白质序列 输入用户E-mail（选填） 模型和模板信息 下载pdb格式文件 模型和模板信息 模型质量参数 与模板序列比对结果并显示二级结构区域 比对结果 模型评估（略） Anolea（Atomic Non-Local Environment Assessment）：is a server that performs energy calculations on a protein chain, evaluating the Non-Local Environment (NLE) of each heavy atom in the molecule. The energy of each pairwise interaction in this non-local environment is taken from a distance-dependent knowledge-based mean force potential that has been derived from a database of 147 non-redundant protein chains with a sequence identity below 25% and solved b