生物学信息分析要领.pptVIP

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  • 2017-06-20 发布于湖北
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相关生物信息学分析及软件的使用 实验目的 了解相关的生物信息学数据库(NCBI数据库等)和掌握数据库检索方法,学会相关软件的使用,并利用生物信息学软件根据研究目的和对象设计引物。 方法 根据酶或基因的名称(GenBank登录号)找到需要的基因的核苷酸序列,根据序列和PCR的目的设计获得该基因的CDS的引物(注意引物设计时引物酶切位点)。 主要数据库介绍 Genebank Genebank库包含了所有已知的核酸序列和蛋白质序列,以及与它们相关的文献著作和生物学注释。它是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)建立和维护的。 NCBI的网址是: EMBL核酸序列数据库 由欧洲生物信息学研究所(EBI)维护的核酸序列数据构成,查询检索可以通过通过因特网上的序列提取系统(SRS)服务完成。 数据库网址是:http://www.ebi.ac.uk/embl/ DDBJ数据库 日本DNA数据仓库(DDBJ)也是一个全面的核酸序列数据库,与Genbank和EMBL核酸库合作交换数据。使用其主页上提供的SRS工具进行数据检索和序列分析。 DDBJ的网址是:http://www.ddbj.nig.ac.jp/ NCBI介绍:NCBI建立在1988年,作为一种公共分子生物学信息资源, 而创建的公开数据库。 NCBI的计划:1.基本研究;2.数据库;3.软件的开发;4.教育和训练 现在我们以查

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