上机演示课件多序列比对与分子进化剖析.pptVIP

上机三多序列比对与分子进化分析 教学目标 了解： 多序列比对的主要方法 基因组进化的意义 理解： 渐进算法的基本原理 系统发育树的构建步骤 掌握： 使用CLustalX、 MUSCLE进行多序列比对 使用MEGA构建系统发育树 资料准备与实验内容 资料下载地址： 下载“上机三_多序列比对与分子进化分析.rar” 资料内容： 多序列比对软件 ClustalX: clustalx-2.1-win.msi 多序列比对软件 muscle: muscle3.6 指导树查看软件TreeView: TreeView 进化分析软件 MEGA4：MEGA4_setup.exe MEGA使用说明：MEGA4.1使用指南.pdf 超级文本编辑器UltraEdit32：UltraEdit-32 来自21个物种的血红蛋白家族序列：HBA.fasta 来自13个物种的酪蛋白家族序列：CASA1.fasta 实验内容 1. 蛋白质家族数据库Pfam的使用 2. 使用ClustalX对血红蛋白alpha亚基家族序列HBA.fasta （HBA）进行多序列比对 3. 使用Muscle对对血红蛋白alpha亚基家族序列HBA.fasta （HBA）进行多序列比对 4.使用MEGA4 ，构建血红蛋白alpha亚基家族HBA （21个物种）的系统发育树 安装程序 安装ClustalX程序 看看程序安装到了何处？