细菌全基因组测序.pptVIP

基因功能注释 测序数据的解读与分析 * * 基因组测序 和组装流程 生物信息学分析流程图 基因注释主要基于蛋白序列比对，将基因的序列与各数据库进行比对，得到对应的功能注释信息。 注释的蛋白库为：KEGG、COG、SwissProt、TrEMBL、NR。 B-6 KEGG代谢通路二级分类图 B-9 KEGG代谢通路二级分类图 B-6 COG功能分类图 B-9 COG功能分类图 B-6 GC含量、GC skew、 COG 注释基因组分布图 B-9 GC含量、GC skew、 COG 注释基因组分布图 基因家族（gene family）和基因簇（gene cluster）分析 包含各基因家族的序列等信息 gene_families 各基因家族内基因两两间的Ka/Ks结果 distance_data/all.KaKs 各基因家族统计信息 genefamily.stat 基因家族聚类结果 genefamily.xls 基因组中来源相同，结构和功能相关的基因 聚集在一起形成基因家族。 基因家族的各个成员紧密成簇排列成大段的串联 重复单位，分布在某一条染色体的特殊区域 解读策略 木质素基质是非常巨大的非均性高分子，会受到细胞外酶或试剂的作用；木质素不含有可水解的化学键，这就意味着木质素降解所参与的酶必须具有氧化性；木质素具有立体结构不规整