植病流行的遗传学基础.ppt

第三节分子生物学技术在植物病害

流行研究中的应用PCR鉴定技术步骤：（1）寻找靶标病原菌（种/小种/生物型）特异的DNA片段，对其序列进行分析。（2）根据DNA序列，设计对靶标病原菌特异的PCR引物。（3）测定PCR引物的特异性和敏感性。（4）开发经济、简便的DNA提取方法用于病原菌的分子鉴定。一、病原菌诊断第30页,共40页，2024年2月25日，星期天二、初始菌量的定量分析1）确定病原菌繁殖速率、病害流行速率及环境影响。巢式PCR、实时PCR2）用于病害指标（普遍率、严重度等）的测定。RFLP等三、病原菌群体的时间动态分析病原菌群体遗传结构、病原群体遗传相似性。第31页,共40页，2024年2月25日，星期天四、病原菌群体的空间动态研究病原菌群体结构在空间上的分布及其变化、病原菌空间分布与群体结构的内在关系。RFLP、AFLP第32页,共40页，2024年2月25日，星期天五、病原菌的远距离传播用特定的分子标记研究不同地理区域之间病菌群体遗传结构的关系；用研究基因漂流的方法探求病原菌可能的传播途径；用系统发育分析方法研究地理远距离区间的基因流动的群体遗传学。第33页,共40页，2024年2月25日，星期天无性生殖的群体内个体之间不存在基因重组，故无性繁殖的群体的系统发育树的长度要明显短于有性重组繁殖群体的系统发育树的长度。AFLP六、病原菌的繁殖方式第34页,共40页，2024年2月25日，星期天ITS序列分析电泳图第35页,共40页，2024年2月25日，星期天ITS序列分析系统发育树第36页,共40页，2024年2月25日，星期天AFLP分析电泳图第37页,共40页，2024年2月25日，星期天AFLP分析系统发育树第38页,共40页，2024年2月25日，星期天第十二章植病流行的计算机模拟技术及软件应用第39页,共40页，2024年2月25日，星期天*感谢大家观看第40页,共40页，2024年2月25日，星期天关于植病流行的遗传学基础Flor对亚麻锈病菌致病性遗传进行了十多年的研究，发现了抗病性与致病性之间的对立关系，于1954年提出基因对基因假说。一、Flor的基因对基因假说第2页,共40页，2024年2月25日，星期天认为在寄主植物中控制抗病性或感病性的基因与在病原菌中控制无毒性或毒性的基因是相对应的，针对寄主植物的每一个抗病基因，病原菌中迟早也会出现一个相对应的毒性基因。一、Flor的基因对基因假说第3页,共40页，2024年2月25日，星期天在自然生态系统中，寄主植物和病原物在生长期的协同进化过程中相互选择、相互适应，达到相互依存的动态平衡状态，表现为病害经常存在，寄主与病原物共存，病害水平不高，偶尔爆发流行但局限于一定时间和空间中，经过一定时间的自动调节，病害又回复到原来的平衡状态。二、自然生态系统中植物群体的遗传防御第4页,共40页，2024年2月25日，星期天从遗传学观点来说，在平衡状态下寄主植物对于病原物的侵染是具备了一套防御机制，理解这套防御机制可以为农业生态系统中建立病害管理系统提供依据和模板。第5页,共40页，2024年2月25日，星期天1、寄主植物和寄生物协同进化协同进化是一个基因调节的过程，寄主植物和病原物在相互选择压力下，各自调节有利于防御病原物侵袭（寄主）和有利于侵染寄主（病原物）的基因频率，相互适应，结果各自形成由这些基因所控制并在一定环境下表现出来的性状，即寄主植物的抗病性和病原物的致病性。第6页,共40页，2024年2月25日，星期天1、寄主植物和寄生物协同进化抗病性和致病性均是由基因控制的表现性状，控制这些性状的基因分别称为抗性基因(Resistantgene)和毒性基因(Virulentgene)。第7页,共40页，2024年2月25日，星期天基因通过重组和突变，经常发生变异。在一个生物群体中，哪些基因保留下来，哪些基因在进化过程中消失了或者说它们在群体中出现的频率下降了，这是由许多内外因素决定的复杂的问题。第8页,共40页，2024年2月25日，星期天在一个寄主和寄生物协同进化的系统，如果其它条件不变，两个种群的遗传组成在很大程度上决定于相互施加的选择压力，并通过遗传反馈，各自进行自我调节，结果导致生态系统中种群和群落的稳定。第9页,共40页，2024年2月25日，星期天2、植物抗病性的遗传学类型和流行学类型遗传学工作者在研究植物抗病性时，采用寡基因抗性和多基因抗性、主效基因抗性和微效基