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鸡源沙门氏菌的分离鉴定、耐药性检测及耐药基因定位的开题报告

一、研究背景

沙门氏菌是一种常见的细菌，常常引起人畜流行病及食物中毒。其中，鸡源沙门氏菌是引起家禽沙门氏菌病的主要病原体。随着家禽养殖业的发展，鸡源沙门氏菌的感染数量也逐渐增加，给养殖业和食品安全带来了隐患。在临床上，沙门氏菌也是一种令人头疼的致病菌，特别是在免疫力低下的人群中，其致病力更强。因此，对鸡源沙门氏菌的分离鉴定、耐药性检测及耐药基因定位等方面的研究有着十分重要的意义。

二、研究目的

本研究旨在对鸡源沙门氏菌进行分离鉴定、耐药性检测及耐药基因定位，为鸡源沙门氏菌的防治和控制提供科学依据。

三、研究内容

1.鸡源沙门氏菌的分离鉴定

从鸡源样品中分离出鸡源沙门氏菌，并通过生化和分子生物学技术对其进行鉴定；

2.沙门氏菌的耐药性检测

对分离出的鸡源沙门氏菌进行耐药性检测，包括常见抗生素的敏感性测试及耐药性谱分析；

3.耐药基因定位

对耐药鸡源沙门氏菌进行PCR扩增并测序，分析其携带的耐药基因类型、多样性和分布情况。

四、研究意义

1.丰富鸡源沙门氏菌的分类鉴定；

2.深入了解鸡源沙门氏菌的耐药性分布和多样性；

3.为鸡源沙门氏菌防治和控制提供可靠的科学数据支持；

4.对类似细菌的耐药性研究提供参考。

五、研究方法

1.样品采集：从鸡样、禽粪及其它环境样品中采集样品；

2.细菌培养：通过对样品的处理及细菌培养，分离出鸡源沙门氏菌；

3.分子鉴定：通过16SrRNA及其他基因序列分析，鉴定鸡源沙门氏菌；

4.耐药性检测：采用药敏试验、MIC测定等方法，对鸡源沙门氏菌的耐药性进行检测，建立耐药性谱；

5.耐药基因测序：通过PCR扩增、测序等方法，测序和分析鸡源沙门氏菌耐药基因。

六、研究难点

1.收集鸡源沙门氏菌及相关实验样品；

2.对鸡源沙门氏菌的分离鉴定方法进行优化；

3.耐药基因及多样性分析方法的确定；

4.耐药性谱的分析和解读。

七、预期结果

1.通过分子技术对鸡源沙门氏菌进行准确的分子检测；

2.得到一份鸡源沙门氏菌的耐药性谱，即耐药类型、扩散率等；

3.鸡源沙门氏菌的耐药性基因分布及多样性分析；

4.选用并优化鸡源沙门氏菌的分离及耐药性检测方法，为研究和诊断奠定基础。

八、研究方案及进度安排

1.样品采集和处理（1个月）

2.鸡源沙门氏菌分离及鉴定（2个月）

3.鸡源沙门氏菌的耐药性测定（2个月）

4.耐药基因测序及分析（3个月）

5.成果报告撰写（1个月）

九、参考文献

1.Oliveira,S.D.,Rodrigues,D.P.(2019).Salmonellainchickenmeat:prevalence,multidrugresistanceandmolecularmechanismsofreducedsusceptibilitytoquinolones.Microorganisms,7(9),340.

2.JanzenT.W.(2016).Salmonellaserovarsandtheirhostspecificity.Veterinarymedicineinternational,2016,1-12.

3.Cronquist,A.B.,Mody,R.K.,Atkinson,R.,Besser,J.,Cole,D.,Eblen,D.,Lafon,P.(2012).Impactsofculture-independentdiagnosticpracticesonpublichealthsurveillanceforbacterialentericpathogens.Clinicalinfectiousdiseases,54(suppl_5),S432-S437.

4.DenBakker,H.C.,Switt,A.M.,Cummings,C.A.,Hoelzer,K.,Degoricija,L.,Rodriguez-Rivera,L.D.,Wiedmann,M.(2011).Awhole-genomesinglenucleotidepolymorphism-basedapproachtotraceandidentifyoutbreakslinkedtoacommonSalmonellaentericasubsp.entericaserovarMontevideopulsed-fieldgelelectrophoresistype.Appliedandenvironmentalmicrobiolog