基因克隆的酶学基础.ppt

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三、碱性磷酸酶(alkalinephosphatase)????主要来源于:牛小肠碱性磷酸酶(Calfintestinalalkalinephosphatase),简称CIP或CIAP细菌的碱性磷酸酶(Bacterialalkalinephosphatase,BAP)第89页,共107页,2024年2月25日,星期天作用催化除去DNA或RNA5‘磷酸的反应用于防止DNA片段自身连接,或标记(5‘端)前除DNA或RNA5磷酸第90页,共107页,2024年2月25日,星期天第91页,共107页,2024年2月25日,星期天第92页,共107页,2024年2月25日,星期天第四节?其它酶一、依赖于DNA的RNA聚合酶(DNAdependentRNApolymerase)????

SP6噬菌体RNA聚合酶(来源于感染鼠伤寒沙门氏菌LT2菌株)T4或T7噬菌体RNA聚合酶(来源于噬菌体感染的大肠杆菌)。第93页,共107页,2024年2月25日,星期天1.活性

????这些RNA聚合酶实际上为转录中的RNA合成酶,识别DNA中各自特异的启动子序列,并沿此dsDNA模板起始RNA的合成。它与DNA聚合酶不同,无需引物,但需识别特异性位点。2.用途

????①体外合成RNA分子。

????②用于表达外源基因。

第94页,共107页,2024年2月25日,星期天二、核酸外切酶(nuclease)?单链外切核酸酶大肠杆菌外切核酸酶I和VII:两头降解,产生2-25bp寡核苷酸片段双链外切核酸酶大肠杆菌外切核酸酶III:双链DNA从3‘OH末端开始降解,释放5’单核苷酸从dsDNA3‘-OH逐一去除单核苷酸的反应,底物为dsDNA或线状和带切口或缺口的环状DNA,反应结果是在dsDNA上产生长长的单链区。该酶还有对无嘌呤DNA特异性内切核酸酶活性、RNaseH活性和3‘-磷酸酶活性(去磷酸)。不降解核酸内的磷酸二酯键,也不降解单链DNA及带3‘突出的dsDNA。持续作用能力不强,产物为切割程度不相上下的群体,有利于分离长短不等的DNA。

第95页,共107页,2024年2月25日,星期天第96页,共107页,2024年2月25日,星期天三单链核酸内切酶1.BAL31核酸酶(BAL31nuclease)

来源于交替单胞菌(Alteromonasespejiana)BAL31主要活性为单链特异的核酸内切酶活性,从3’羟基末端迅速降解DNA依赖Ca++,而且EGTA(乙二醇-双-(2-氨基乙基)四乙酸)可抑制其活性。

双链的核酸外切酶活性:可从线性DNA两条链的两端迅速去除单核苷酸第97页,共107页,2024年2月25日,星期天用途从两头缩短DNA,用于构建嵌套缺失体制作DNA限制酶切图;确定DNA二级结构从单链RNA上去除核苷酸。第98页,共107页,2024年2月25日,星期天2.Sl核酸酶(S1nuclease)来源于米曲霉(Aspergillusoryzae)降解单链DNA或RNA,产生带5‘磷酸的单核苷酸或寡核苷酸双链,是一种高度单链特异的核酸内切酶对dsDNA、dsRNA和DNA:RNA杂交体不敏感。活性需pH4.0-4.3,Zn2+酶浓度大时可完全消化双链,中等浓度可在切口或小缺口处切割双链。作用:分析DNA:RNA杂交体的结构;去掉双链核酸中突出的单链尾从而产生平末端;打开双链cDNA合成中产生的发荚环。

第99页,共107页,2024年2月25日,星期天第100页,共107页,2024年2月25日,星期天3.核糖核酸酶A(RibonucleaseA或RNaseA)来源于牛胰,为内切核酸酶可特异攻击RNA上嘧啶残基的3‘端可用于除去DNA:RNA中未杂交的RNA区,确定DNA或RNA中单碱基突变的位置。广泛用来去除DNA样品中的RNA。

???

第101页,共107页,2024年2月25日,星期天4.脱氧核糖核酸酶Ⅰ(DNaseⅠ)来源于牛胰,是内切核酸酶可优先从嘧啶核苷酸的位置水解双链或单链DNA。产物是以5’-磷酸为末端的寡核苷酸。

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