identification of cancertestis-antigen genes by massively parallel signature sequencing通过大规模并行特征测序鉴定癌抗原基因.pdfVIP
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Identificationofcancer-antigengenes
bymassivelyparallelsignaturesequencing
†‡†††§§
Yao-gChen*,MatthewJ.Scanlan,CharisA.Venditti,RamonChua,GregoryTheiler,BrianJ.Stevenson,
ChristianIseli§†¶§†
,AliO.Gure,TomVasicek,RobertL.Strausberg,C.VictorJongeneel,LloydJ.Old,
andAndrewJ.G.Simpson†
*WeillMedicalCollegeofCornellUniversity,NewYork,NY10021;†LudwigInstituteforCancerResearch,NewYorkBranchatMemorialSloan–Kettering
CancerCenter,NewYork,NY10021;§OfficeofInformationTechnology,LudwigInstituteforCancerResearchandSwissInstituteofBioinformatics,1015
¶
Lausanne,Switzerland;LynxTherapeutics,Hayward,CA94545;andTheInstituteforGenomicResearch,Rockville,MD20850
ContributedbyLloydJ.Old,March30,2005
Massivelyparallelsignaturesequencing(MPSS)generatesmillionsCollegeofCornellUniversityandMemorialSloan–KetteringCan-
ofshortsequencetagscorrespondingtotranscriptsfromasinglecerCenter.Celllineswereobtainedfromthebankmaintainedat
RNApreparation.MostMPSStagscanbeunambiguouslyassignedtheLudwigInstituteforCancerResearch,NewYorkBranch.
togenes,therebygeneratingacomprehensiveexpressionprofile
ofthetissueoforigin.FromthecomparisonofMPSSdatafrom32MPSS.PoolednormalhumsueRNApreparationswerepur-
normalhumsues,weidentified1,056genesthatarepredom-chasedfromClontech.Inaddition,mRNAwaspurifie
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