identification of cancertestis-antigen genes by massively parallel signature sequencing通过大规模并行特征测序鉴定癌抗原基因.pdfVIP

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标题大量支持性定量标记序列MPSS识别癌症靶向基因的综述摘要本文使用大量支持性定量标记序列MPSS系统对已知癌症靶向基因进行了深入研究这种方法通过大规模并行特征测序鉴定了癌抗原基因,并提供了一种全面表达途径来了解细胞起源我们的结果证实了MPSS能够提供丰富的基因表达信息,并可能有助于开发新的治疗策略关键词癌症,靶向基因,MPSS,基因表达,肿瘤抗原,表达平台,功能分析,可视化

Identificationofcancer-antigengenes

bymassivelyparallelsignaturesequencing

†‡†††§§

Yao-gChen*,MatthewJ.Scanlan,CharisA.Venditti,RamonChua,GregoryTheiler,BrianJ.Stevenson,

ChristianIseli§†¶§†

,AliO.Gure,TomVasicek,RobertL.Strausberg,C.VictorJongeneel,LloydJ.Old,

andAndrewJ.G.Simpson†

*WeillMedicalCollegeofCornellUniversity,NewYork,NY10021;†LudwigInstituteforCancerResearch,NewYorkBranchatMemorialSloan–Kettering

CancerCenter,NewYork,NY10021;§OfficeofInformationTechnology,LudwigInstituteforCancerResearchandSwissInstituteofBioinformatics,1015

Lausanne,Switzerland;LynxTherapeutics,Hayward,CA94545;andTheInstituteforGenomicResearch,Rockville,MD20850

ContributedbyLloydJ.Old,March30,2005

Massivelyparallelsignaturesequencing(MPSS)generatesmillionsCollegeofCornellUniversityandMemorialSloan–KetteringCan-

ofshortsequencetagscorrespondingtotranscriptsfromasinglecerCenter.Celllineswereobtainedfromthebankmaintainedat

RNApreparation.MostMPSStagscanbeunambiguouslyassignedtheLudwigInstituteforCancerResearch,NewYorkBranch.

togenes,therebygeneratingacomprehensiveexpressionprofile

ofthetissueoforigin.FromthecomparisonofMPSSdatafrom32MPSS.PoolednormalhumsueRNApreparationswerepur-

normalhumsues,weidentified1,056genesthatarepredom-chasedfromClontech.Inaddition,mRNAwaspurifie

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