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2004 (4) 陕 西 农 业 科 学 ·35 ·
·讨论与建议 ·
IT S 序列分析及其在植物真菌病害分子
检测中的应用
赵 杰
(西北农林科技大学 植保学院, 陕西 杨凌 712100)
提 要: 近年来, 利用 PCR 扩增病原菌核糖体 IT S (internal transcribed spacer) 基因区段进行病原菌鉴
定、检测及病害诊断技术得到了发展, 利用病原菌在 rDNA 的 IT S 区段既具保守性又在科、属、种水平
上均有特异性序列的特性, 对 IT S 区进行 PCR 扩增、测序及序列分析后再设计特异性引物来诊断和检
测植物病原菌, 尤其是植物病原真菌的分子检测已越来越被广泛应用。
关键词: rDNA - IT S; 病原真菌; 分子检测
近年来, 利用 PCR 扩增病原菌核糖体 IT S 个不同的非编码区域, 即 IT S1 和 IT S4 。IT S 序列
( in ternal tran scribed spacer) 基因区段进行病原 在物种属内、近缘属间及至科内系统进化关系研
菌鉴定、检测及病害诊断技术得到了发展[ 7～ 9 ] 。由 究中有一定的价值。真菌核糖体基因(ribo som al
于这种方法快速、准确和简便, 因而, 越来越受到 , ) ( ) 区、5. 8
由小的亚单元 18 、
DNA rDNA S IT S1 S
( ) ( )
植物病理学家们的重视。本文就 在植物真菌 区、 区和大的亚单元 28 构成 图 1 , 头尾
IT S IT S2 S
病害分子检测中的应用作一简述。 串联形成重复序列, 一个基因组内有 60～ 200 个
拷贝。真菌 IT S 区域长度一般在 650～ 750 bp (碱
1 IT S 及其引物
)
基对 。rDNA 多复制的特性, 有利于低浓度或被
核糖体 内转录 间隔区( In ternal tran scribed 更高度降解的DNA 样品中 IT S 区域的扩增。
, ) 位于 片段上, 包含两
spacer IT S rDNA rRNA
图 1 IT S 区段 PCR 扩增引物示意
等为真菌 基因的 设计了 3 和 28 之间的转录间隔区 [ 6 ]。
W h ite rRNA IT S S rDNA S rDNA IT S2
对特异引物, 即 、 、 , 用于大多数担
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