广东雷州地区3种滨珊瑚系统发生关系的研究.pdfVIP

第 33 卷 第 4 期 广东海洋大学学报 Vol.33 No.4 2013 年 8 月 Journal of Guangdong Ocean University Aug. 20 13 广东雷州地区 3 种滨珊瑚系统发生关系的研究 刘 皓，骆学贤，周 操，刘 丽 （广东海洋大学水产学院 ，南海水产经济动物增养殖广东普通高校重点实验室 ，广东 湛江 524025 ） 摘要：对雷州常见的 3 种滨珊瑚科珊瑚 ：澄黄滨珊瑚 （Porites lutea ）、灰黑滨珊瑚 （Porites nigrescens ）、普哥滨 珊瑚 （Porites pukoensis ），共 32 个样本的 12S rRNA 基因序列进行了 PCR 扩增和测序 ，研究其系统发生关系 。结 果显示 ，所得的 3 种珊瑚的 12S rRNA 基因长度在 728 ～908 bp 之间 ，G+C 含量在 34.3% ～39.2%之间 ，遗传距离 在 0.004~0.019 之间。利用邻接 （NJ ）法 、最大似然 （ML ）法和不加权对群分析 (UPGMA)法构建的系统进化树 显示 ：3 种珊瑚被分成了 2 个支系 ，澄黄滨珊瑚和灰黑滨珊瑚聚合在一个分支上 ，而普格滨珊瑚在另一支 ，这一 研究结果与传统形态学分类研究的结果存在一定差异。 关键词：滨珊瑚 ；12S rRNA；系统进化 中图分类号：Q959 文献标志码：A 文章编号：1673-9159 （2013 ）04-00 17-05 Phylogenetic Relationships of Poritidae in Leizhou Based on 12S rRNA Sequences LIU Hao, LUO Xue-xian, ZHOU Cao, LIU Li (Fisheries College, Guangdong Ocean University,Key Laboratory of Aquaculture in South China Sea for Aquatic Economic Animal of Guangdong Higher Education Institutes , Zhanjiang 524025 China) Abstract ：By PCR amplification and sequencing, out of 3 species of coral (Poritidae, porites ), Porites lutea, Porites nigrescens and Porites pukoensis, in Leizhou region, a total of 32 samples of 12S rRNA gene sequences were obtained and their phylogenetic relationships were studied. The results indicated that the sequence length was ranged from 728 bp to 908 bp, content of G and C was between 34.3% and 39.2%, the genetic distance was between 0.004 and 0.019. From the phylogenetic trees constructed by using neighbor joining (NJ), Maximum Likelihood (ML) and Unweighted Pair Group with Mathematical A