外显子芯片对肌萎缩侧索硬化模型鼠腰髓组织的分析及机制探讨.pdfVIP

Chinese Prcti (~ Gel1n3e麓rala 期ce 4} · l2o1o冉 第 第 c 3761 · · 论 著 · 外显子芯片对肌萎缩侧索硬化模型鼠腰髓组织的分析及 机制探讨 ‘ 胡 明，郭艳苏，陈慧芳，段伟松，常 庚，李春岩 【摘要】 目的 从基因表达水平和外显子选择性剪接水平探讨肌萎缩侧索硬化 (amyotrophiclateralsclerosis， ALS)模型鼠 (hSOD1一G93A基因型阳性小鼠)发病相关的基因和信号通路，分析症状前期转录水平的改变及可能的 发病启动机制。方法 筛选鉴定hSOD1一G93A基因型阳性雌性d、鼠发病早期 (30d)做研究组 (30A组)，以同窝同 龄 SOD1一G93A基 因型阴性雌性小鼠做对照组 (30C组)，应用Aflymetrix小鼠外显子芯片检测小鼠腰髓组织的基 因转 录本及可变剪接事件，并对相关基因进行功能分类 (geneontologyhierarchyanalysis，GO分类)及生物学通路分析。结 果 在30A组和 30C组两组比较中，基因表达谱水平仅有 1个基 因 (未知基因)在 30A组中表达高于30C组2倍 以 上，共有4个基因在30A组的表达高于30C组1．5倍以上，且仅有 1个基因为已知基因 (NM一030707)。未发现有 1．5 倍以上表达下调的基因。在外显子水平，共有85个发生选择性剪接的外显子，分别属于85个转录本，仅有36个已知 基 因。对 NM一030707基 因及 36个可变剪接基 因进行 GO分析及通路分析 ，得 出其功能及涉及 的信号转导通路 。结论 与30C组相比，在基因表达水平，致病性hSOD1一G93A在 ALS症状前期影响不大；在转录水平，发现 了新的异常 剪接基因。推测出现的新基因及新的异常剪接事件可能与hSOD1一G93A基因在症状前期致病性有关。 【关键词】 肌萎缩侧索硬化；腰髓；外显子芯片；基因表达谱；选择性剪接 【中图分类号】R746．4 【文献标识码】A 【文章编号】1007—9572(2010)l1—3761—05 ExonArrayAnalysisofLumbarSpinalCordfrom hSOD1一G93A TransgenicM iceandExplorationofPathogenesis HU Ming，GUOYan—SU，CHENHui一 ng，ela1．DepartmentofNeurplogy，SecondHospitalofHebeiMedicalUnivemity，Sh~ii— azhuan050000，China A【bstract】 Objective Tostudythedifferentialexpressionofgenesandtheamountofalternativeexonsplicingevents inspinalcordsamplesofmousemodelofALS，whichwereinasymptomatiestage．Thechangeswereanalyzedintranscription levelsofearlystageinALS，helpingUStoexplorethepossibleinitiatorofALS．Methods ByusingAffymetrlxMouseExon 1．0STarrays，weanalyzedthetranscriptionprofilesofthelumbarspinalcordremovedfromthreefemaleSOD1一G93Amice(30 一 daysofage)andthreefemalenon—transgeniclittermates．ByusingMAS(MoleculeAnno