桃脂氧合酶基因()家族cDNA全长克隆与序列分析.pdfVIP

桃脂氧合酶基因()家族cDNA全长克隆与序列分析.pdf

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农业生物技术学报 Journal ofAgriculturalBiotechnology 2009,17(6): 1056~1061  ·研究论文 · 桃脂氧合酶基因(  )家族 cDNA全长克隆与序列分析 *  ,  ,  **,  张 涛 智军海 赵彩平  韩明玉 , , 712100 (西北农林科技大学园艺学院 农业部西北园艺植物种资源利用重点开放实验室 杨凌 ) : , 从瑞蟠 5 ( Ruipan 5 果肉总 RNA 795bp 摘要 根据脂氧合酶保守序列设计 的简并引物 号桃 ‘ ’ ) 中扩增 出 ( 的脂氧合酶 lipoxygenase, ) 基因 的保守序列 , 并结合 GenBank 中公开 的 基因 的 EST序列经 Blast 比对分析、 序列组 ( 利用 ,分别命名为 装之后设计基因特异引物 GSP)。 RACE技术共获得 3 条不 同的桃 基 因 cDNA 全长序列 GenBank :EU883638 FJ029110 FJ032015 , 这 3 LOX ( 登录号 、 和 )。 序列分析结果表明 个桃 基因家族成员与其它植物的 基 因尽管在核酸水平上 的差异比较大 , 但在蛋 白水平上却有较高的 同源性。通过对桃 基 因蛋白序列和其它植物 LOX进行 发现 13­LOX 9­LOX 系统进化树分析, 属于 , 属于 。 : ; 桃; 关键词 脂氧合酶 EST; 基因家族 中图分类号: S188  文献标识码: A  文章编号: 1006­1304(2009)06­1056­06  CloningandAnalysisofFull­length LipoxygenaseGene (  ) Family cDNA  ZHANGTao,ZHIJun­hai,ZHAOCai­ping**,HAN Ming­yu  Theconservativeregion oflipoxygenasegene (  ) from fruittotalRNA ofpeach (  cv Ruipan 5)was  amplifiedusingdegenerateprimers,whichwas combinedwiththe ESTsof  genesfrom GeneBank,andthe GSPprimerswerede­  signed after Blast aligning and sequence installing. Three full­length different cDNA sequences were obtained,

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