基因组的测序与分析.docVIP

人类基因组计划 HGP：人类基因组计划(Human Genome Project) 基因组测序 基因组分析 其他基因组的测序与分析 人的基因这么少，却能行使复杂的功能的原因： 一个基因对应多个产物：可变剪切和蛋白修饰 垃圾基因的功能：非蛋白编码基因的重要功能 任务与进展 完成四张图：遗传图谱、物理图谱、转录图谱、序列图谱 遗传图谱（Genetic map） 定义 又称连锁图谱（linkage map)或遗传连锁图谱(genetic linkage map) ，是指人类基因组内基因以及专一的多态性DNA标记(marker)相对位置的图谱，其研究经历了从经典的遗传图谱到现代遗传图谱的过程。　　 经典的遗传图谱（以基因表型为标记） 现代遗传图谱（以DNA为标记） 多态性（polymorphism）：人的DNA序列上平均每几百个碱基会出现一些变异（variation），并按照孟德尔遗传规律由亲代传给子代，从而在不同个体间表现出不同，因而被称为多态性。 第一代多态性标记：限制性片段长度多态性-RFLP 第二代多态性标记：短的串联重复序列：小卫星DNA、微卫星DNA 第三代多态性标记：单核苷酸的多态性-SNP 物理图谱（Physical map） 定义 用物理学方法构建的由不同的DNA结构按其在染色体上的原始顺序和实际距离排列的图谱。以定位的DNA标记序列如序列标签位点STS作为路标，以DNA实际长度即bp、kb、Mb为图距的基因组图谱。 序列标签位点(sequence-tagged site, STS)图谱。(STS是染色体定位明确且可用PCR扩增的单拷贝序列)。 转录图谱 定义 以EST（expressed sequence tag ，表达序列标签）为标记，根据转录顺序的位置和距离绘制的图谱。 序列图谱（分子水平的物理图谱） 定义 序列图谱是指整个人类基因组的核苷酸序列图，也是最详尽的物理图谱。 既包括可转录序列，也包括非转录序列，是转录序列、调节序列和功能未知序列的总和。 二、大规模测序的策略 定向：逐步克隆法（clone by clone） 随机：全基因组鸟枪法（ whole genome shot-gun）