新发A／H1N1流感病毒的分子生物学特征.pdfVIP

浙江省医学科学院学报2009年 6月(总第 77期) - l7· · 讲座 · 新发A／H1N1流感病毒的分子生物学特征 沃恩康 吴海波 王怡婷 王闻哲 李颖 汪一帆 尤金彪 王怡 郭潮潭 流行性感冒简称流感 ，是由A、B、C三种 步分析 ，发现此次流行 的病毒株包含一种较 流感病毒引起的急性呼吸道传染病。A型流 为独特的基因片段组合 ，是来 自中北美和欧 感病毒根据其血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA) 亚两种猪流感病毒的混合体，但并未发现其 基 因的不同又可分为 16个 HA亚型和 9个 具有典型的人流感和禽流感病毒特征。先前 NA亚型 ”【。猪流感是一种 由A型流感病毒引 报道的本次新型流感病毒集 中呈现 了猪流 起 的猪呼吸系统疾病。今年 3月份 由墨西哥 感病毒、人流感病毒和禽流感病毒的特征 ， 发端的流感疫情截至 5月 8日，已蔓延至 36 是来 自猪 、人和禽类等多物种来源 的流感病 个 国家和地区，其 中23个 国家 已有确诊病 毒杂交体的说法值得商榷。 例 ，2个国家有患者死亡。根据疫情病原体的 1．1HA基 因 基因组特征，其属于新型H1N1亚型猪流感 本次流行的流感毒株的HA基因核苷酸 病毒 ，世界卫生组织称之为猪流感。虽然这 序列与早期从美 国分离到的H1N2的猪流感 种新型病毒是 由猪流感病毒演变而来 ，但到 病毒株 的同源性达到 93％以上 ，其 中与印第 目前为止这种病毒 只导致人类患病 ，并在人 安纳州的H1亚型猪流感病毒(A／Swine／Indi— 与人之间传播 ，而猪感染仅发现一个病例 ， ana／P12439／000t1N2))具有 95％的同源性 。 也没有有力证据证 明本次流感疫情是从 由 提示本次A／H1N1流感病毒的HA基因由中 猪传播开来的。因此，4月 30 日世界卫生组 北美洲本地的猪流感病毒变异而来。 织将本次疫情改称为A／H1N1流感 ，不再使 1．2NA和 M基因 用 “猪流感”一词。基于此次流感疫情的特殊 NA基 因没有发生核苷酸缺失 ，其序列 性和严峻性，本文利用 自创的流感病毒信息 具有欧亚株系猪流感病毒的特征，同源性在 库和快速分析平台，并结合美 国国立生物技 9O％以上 的病毒都是来源于欧亚地 区的 术信息中心在线 比对系统，对新型流感病毒 H1N1猪流感病毒 ，其 中与 A／Swine／England／ 的分子生物学特征进行分析，现综述如下 。 195852／92(H1N1)，MSwine／Spain WL6／1991 1基因特征与猪流感病毒相同 (H1N1)的核苷酸同源性达到了94％以上。M 分析 比对 已报道 的22株病毒序列 ，各 基 因的核苷酸序列也与欧亚株系的猪流感 地分离株的核苷酸序列同源性达 99％以上 ， 病毒的同源性最高 ，达到 96％。提示NA和 M 属于同一株病毒。对 HA和 NA基因进行分 基因来源于欧亚株系的猪流感病毒。 析 ，确认引起本次疫情 的病原体属于 1．3其它基因 H1N1流感病毒。同时以 CaHfomia／04／2009 PB1、PB2、NP、NS基因的核苷酸序列与 分离株为代表 ，对其整个基因组序列行进一 美韩等国分离到的猪流感病毒同源性最高， 基金项 目：国家 自然科学基金，浙江省科技厅重大项 目(2007F