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人兽共患致病菌的比较基因组学和功能基因组学研究 王磊 (南开大学泰达生物技术学院300457， E-mail：wanglei@nankai．edu．cn) 一些细菌能够在人类和脊椎动物之间自然感染与传播，并引起人类和动物共 患的传染病，被称为人兽共患致病菌，其对人类健康、畜牧业生产、畜产品安全 和公共卫生均会造成重大危害。 人兽共患致病菌研究中的主要科学问题包括三方面：1，人兽共患致病菌的 致病性形成机理；2，人兽共患致病菌的宿主特异性致病机制；3，人兽共患致病 菌在宿主体内的进化规律。 针对以上科学问题，本实验室近年来进行了以下工作： 1．通过大肠杆菌0157：H7和055：H7的比较基因组学研究揭示致病性大肠杆 菌的形成机理(科学问题一)。 首次解析了由大肠杆菌055：H7进化形成0157：117的过程中的全部遗传事件， 发现重组和噬菌体介导的插入是055：H7与0157：H7抗原型及致病性差异的主要 0157：H7仍在快速进化中。 2．对进化关系很近，但宿主特异性和致病性不同的致病菌进行比较基因组 学研究，从而揭示其宿主特异性致病机制(科学问题二)。 对两株产志贺毒素型大肠杆菌0156：H25(亲缘关系紧密、但宿主分别为牛 和羊，且对人的致病性不同)进行了基因组破译和比较，发现基因组的差异主要由 不同的噬菌体和基因组岛造成，该差异基因可能与菌株宿主特异性和致病性相关。 3．利用转录组学研究人兽共患致病菌在人细胞内的致病机制(科学问题--)。 建立了细菌核糖体RN^消除技术，从而为高效获得信使RNA用于转录组测序 奠定基础；完成了人类专属致病菌一志贺氏菌在人体细胞内的转录组学研究，发 现了大量表达差异的基因和非编码RNA；正在进行宿主不同的致病性大肠杆菌在 人体细胞内的转录组学研究工作。 4．对尿道致病性大肠杆菌在人和狗体内的进化规律进行研究(科学问题三)。 对14个在三年时间内、分离自同一家庭的(5个家庭成员和1只狗)的同 一尿道致病性大肠杆菌菌株进行比较基因组研究，首次计算出致病菌在宿主体内 X 的实际突变率为：2．2610‘7突变每位点每年，比之前人们估计的突变率要高 2 6—8倍；发现该菌在三年时I’日J内至少发生了6次在不同宿主问的传播，首次为 尿道致病性大肠杆菌可在人与动物阳J传播提供了较为有力的证据。 人兽共患致病菌造成的新发传染病近年来持续上升(占60．3％)，严重威胁 人类健康，因此人兽共患致病菌快速检测方法的发展对疾病预防及控制、畜牧业 生产、食品安全检测具有重要作用。我们通过比较基因组学方法，筛选获得了 520余种入兽共患致病菌的特异分子标识，并建立了国际上容量最大的特异分子 标识库，可以用于人兽共患致病菌的分子生物学鉴定和检测。 welearnfrom Haemophilusparasuis．．What the genome sequencing Rui Chcn Zhou，WeichengBei，ZhuofeiXu，Huanchun (State KeyLaboratoryofAgricultural Microbiology,CollegeofVeterinaryMedicine，Huazhong AgriculturalUniversity,Wuhan 430070；Email：rzhou@mail．hzau．edu．on) memberofthe beeithera Haemophilusparasuis，a