串联质谱法测定生物样本全基因组DNA甲基化.pdfVIP

第 40 卷 分析化学 (FENXI HUAXUE) 研究 第期 2012 年月 Chinese Journal of Analytical Chemistry ~ : / DOI 10.3724SP.J.1096.2012.11255 液相色谱 串联质谱法测定生物样本全基因组 甲基化 - DNA * * 彭思远 张 洁 田美平 王展林 申河清 ( , ) 中国科学院城市环境研究所城市环境与健康重点实验室 厦门 36102 1 , 摘 要 建立了基于液相色谱 电喷雾串联质谱的分析方法 对生物样本中全基因组 DNA 甲基化水平进行定 - 。 , , 量测定 首先将 DNA 从生物样本中提取出来 将 DNA 片段酶解为单核苷酸 利用液相色谱 串联质谱测定胞 - , 。 嘧啶和 5 甲基胞嘧啶的含量 从而计算出其全基因组 DNA 甲基化率 利用该法研究了暴露于全氟辛烷磺酸 - 、 , 的L 02 细胞 10 例原发性肝癌病例血浆样本和 10 例对照血浆样本的全基因组 DNA 甲基化水平 得出了它们 - 。 , , , 的总甲基化率变化的初步结果 本方法操作简单 具有很高的灵敏度和稳定性 为研究生物样本 尤其是临床 上易得但 DNA 含量极低的血浆样本的总甲基化水平提供了思路。 ; ; ; ; ; 关键词 DNA 甲基化 液相色谱 质谱 血浆 细胞 全氟辛烷磺酸 引 言 1 , 生物基因组的表观遗传信息在基因表达的调控中具有重要作用 它可以随着外界环境因素的变化 , 。 ( ) , 而改变 与环境暴露有密切关系 通过表观基因组 Epigenomics 的变化 可以更深入地理解环境污染 。 , 物对生物的负面影响 DNA 甲基化是最常见的一种表观遗传学修饰 在 DNA 甲基转移酶的催化作用 , ( ) 。 下 胞