4种竹子木质素合成酶PAL基因克隆和序列分析.pdfVIP

鞋 eV 1ei 4种竹子木质素合成酶 PAL的基 因 克隆和序列分析 李潞滨 ’，刘 蕾 ，张淑萍 ，一，何聪芬 ，胡 桃 ’，庄彩云 1．中国林业科 学研 究院林业研 究所；国家林业局林木培育重点实验室，北京 100091 2．北京工商大学化学与环境工程学院：植物资源研究开发北京市重点实验室，北京 100048 3．首都师范大学生命科学学院．北京 100048 摘要 苯丙氨酸解氨酶 (PhenylalanineAmmonia—Lyase，PAL；EC4．3．1．5)是木质素生物合成过程 的关键酶和 限速酶 。应用 RACE(Rapid—AmplificationofcDNAEnds)方法 ，获得 了ac哺鸡竹 (Phyllostachysdulc~)、高节竹 (Phyllostachysprominens)、龙 鳞竹 (Phyllostachyspubescensheterocycla)、丽水苦竹 (PleioblastusmaculosoidesWen)等 4种竹子 ￡-基 因的全长序列 ，并 进行了生物信息学分析 。结果表明，尸 L基 因的开放读 码框长度 为 2136bp，共编码 712个氨基 酸 ，具有 2个外显子和 1个 内含 子。其中高节竹、龙鳞竹、丽水苦竹 尸 L基因内含子长度为 121bp，白哺鸡竹 L基因内含子长度为 84bp。推测其氨基酸序列，并 分析PAL蛋白单体的三维结构，结果显示PAL蛋白均含有大量的 螺旋和卢折叠结构。基于邻接法的进化树对31个物种的 L 基因的氨基酸序列分析表明。竹类植物 ￡-基 因的保守性较高 ，与禾本科植物玉米 、甘蔗的亲缘关系较近 ，与双子叶植物辣椒等 的 亲缘关系较远 。 关键词 竹 ：木质素 ；苯丙氨酸解氨酶 ；RACE 中圈分类号 Q783 文献标识码 A 文章编号 1000—7857(2009)22-0019-07 GeneCloningandSequence Abstract PhenylalanineAmmonia—Lyase(PAL，EC4．3．1_5)isone ofthekeyenzymesintheprocessofligninsynthesis．Inthispaper， AnalysisofPhenylalanine L genesequencesfrom fourvarietiesofbamboo：Phyllostachys AAmmmmoonniiaa-LLyaseinBaambOoOo dulcis， Phyllostachys prominens， Phyllostachys pubescens heterocycla and Pleioblastusmaculosoides Wen，wereobtained by LigninSynthase Rapid—AmplificationofcDNAEnds (RACE)．Theresultsshowthat each PAL gene has two exons and an intron and every Open LILubin，LIULei，ZHANGShuping，HECon~en， ReadingFrame (ORF)is2136bpinl