用聚类法分析受抗真菌物质处理后的酵母细胞全基因表达谱.pdfVIP

· · 生物化学与生物物理进展 ； （） #’ #$%’()%*+,-’()%+0’ $$ 12 % ./ 用聚类法分析受抗真菌物质处理后的 酵母细胞全基因表达谱! ，） ，） ，） ） 张 亮! 张 岩! 周一鸣! 安 爽 ） ，，） ） ，，，） # !$ !$% !! 果德安 周玉祥 曾令文 程 京 ） ） ） ! $ （清华大学生物科学与技术系， 清华大学生物膜与膜工程国家重点实验室， 生物芯片北京国家工程研究中心， ） ） % # 清华大学医学院药理系，北京 ； 北京大学天然药物及仿生药物国家重点实验室，北京 ） !’% !’ 摘要 微阵列()*芯片技术可以并行分析成千上万个基因的表达情况，它为研究药物的作用机制提供了一个新 的高效技术平台 用 种已知和未知作用机理的抗真菌化合物处理酵母细胞，并得到酵母细胞的全基因表达谱， + , 然后对其进行聚类分析 结果表明作用机制类似的化合物具有相近的聚类关系 两性霉素 和制霉菌素、酮康 + + - 唑和克霉唑都是已知的作用机制类似的抗真菌药物+通过对基因表达谱进行聚类分析，发现前一组和后一组分 别被聚类在一起 另外已知澳洲茄胺抑制的是细胞膜上麦角固醇的合成，聚类分析表明它与酮康唑，克霉唑的 + 聚类很靠近+对微阵列()*芯片产生的基因表达谱进行聚类分析，由于作用机制相似的药物会被聚类在一起， 因此根据未知药物和已知药物的聚类关系，可以了解未知药物的作用机制，这对于加速新药开发的步伐具有十 分重要的意义+ 关键词 微阵列()*芯片，抗真菌药物，聚类分析 学科分类号 ./’ 微阵列()*芯片技术可以一次并行检测成千 成一个家谱的树状结构，其中树枝的长度所表示的 上万个基因的表达情况，已在药物研发中得到应 是两组数据的相似程度+在构建酿酒酵母全基因组 ［］ 用 ! 随着大规模基因测序工作的进展，有超过 微阵列 芯片的基础上，我们用 个具有抗真 + ()* , ［］ $ 菌活性的物质处理酵母细胞得到各自的基因表达 种微生物的基因组已经完成了测序工作 ，因 % 而可以利用这些信息构建相应生物的全基因组微阵 谱，然后对基因表达谱的数据进行聚类分析 聚类 + ［］