大肠杆菌质粒DNA的提取.docVIP

一、大肠杆菌质粒DNA的提取 质粒DNA的提取是从事基因工程工作中的一项基本实验技术，但提取方法有很多种，以下介绍一种最常用的方法： 碱裂解法：此方法适用于小量质粒DNA的提取，提取的质粒DNA可直接用于酶切、PCR扩增、银染序列分析。方法如下： 1、接1%含质粒的大肠杆菌细胞于2ml LB培养基。 2、37℃振荡培养过夜。 3、取1.5ml菌体于Ep管，以4000rpm离心3min，弃上清液。 4、加0.lml溶液I(1％葡萄糖，50mM/L EDTA pH8.0，25mM/L Tris-HCl pH8.0)充分混合。 5、加入0.2ml溶液 II(0.2 mM/L NaOH，1％ SDS)，轻轻翻转混匀，置于冰浴5 min 。 6、加入0.15m1预冷溶液III(5 mol/L KAc，pH4.8)，轻轻翻转混匀，置于冰浴5 min 。 7、以10，000rpm离心20min，取上清液于另一新Ep管 8、加入等体积的异戊醇，混匀后于?0℃静置10min。 9、再以10，000rpm离心20min，弃上清。 10、用70％乙醇0．5ml洗涤一次，抽干所有液体。 11、待沉淀干燥后，溶于0．05mlTE缓冲液中 煮沸法 　　1、将1.5ml培养液倒入eppendorf管中,4℃下12000ｇ离心30秒。 　　2、弃上清，将管倒置于卫生纸上几分钟，使液体流尽。 　　3、将菌体沉淀悬浮于120ml STET溶液中, 涡旋混匀。 　　4、加入10ml新配制的溶菌酶溶液(10mg/ml), 涡旋振荡3秒钟。　　5、将eppendorf管放入沸水浴中,50秒后立即取出。 　　6、用微量离心机4℃下12000g离心10分钟。　　7、用无菌牙签从eppendorf管中去除细菌碎片。 　　8、取20ml进行电泳检查。 　　[注意] 1. 对大肠杆菌可从固体培养基上挑取单个菌落直接进行煮沸法提取质粒DNA。　　2. 煮沸法中添加溶菌酶有一定限度,浓度高时,细菌裂解效果反而不好。有时不同溶菌酶也能溶菌。 　　3. 提取的质粒DNA中会含有RNA,但RNA并不干扰进一步实验,如限制性内切酶消化,亚克隆及连接反应等。 质粒DNA的大量提取和纯化 　　在制作酶谱、测定序列、制备探针等实验中需要高纯度、高浓度的质粒DNA,为此需要大量提取质粒DNA。大量提取的质粒DNA一般需进一步纯化,常用柱层析法和氯化绝梯度离心法。 （一）、碱法 　　1、取培养至对数生长后期的含pBS质粒的细菌培养液250ml，4℃下5000g离心15分钟,弃上清,将离心管倒置使上清液全部流尽。 　　2、将细菌沉淀重新悬浮于50ml用冰预冷的STE中（此步可省略）。 　　3、同步骤1方法离心以收集细菌细胞。 　　4、将细菌沉淀物重新悬浮于5ml溶液I中,充分悬浮菌体细胞。 　　5、加入12ml新配制的溶液II, 盖紧瓶盖,缓缓地颠倒离心管数次,以充分混匀内容物,冰浴10分钟。 　　6、加9ml用冰预冷的溶液III, 摇动离心管数次以混匀内容物,冰上放置15分钟,此时应形成白色絮状沉淀。　　7、4℃下5000g离心15分钟。 　　8、取上清液,加入50ml RNA酶A(10mg/ml), 37℃水浴20分钟。 　　9、加入等体积的饱和酚/氯仿,振荡混匀,4℃下12000g离心10分钟。 　　10、取上层水相, 加入等体积氯仿,振荡混匀,4℃下12000g离心10分钟。 　　11、取上层水相,加入1/5体积的4mol/L NaCl和10% PEG(分子量6000), 冰上放置60分钟。 　　12、4℃下12000g离心15分钟, 沉淀用数ml 70%冰冷乙醇洗涤，4℃下12000g离心5分钟。 　　13、真空抽干沉淀，溶于500ml TE或水中。 　　[注意] 1. 提取过程中应尽量保持低温。 　　2. 加入溶液II和溶液III后操作应混和,切忌剧烈振荡。 　　3. 由于RNA酶A中常存在有DNA酶,利用RNA酶耐热的特性,使用时应先对该酶液进行热处理(80℃ 1小时),使DNA酶失活。 三、大肠秆菌感受态细胞的制备 感受态的细胞可以摄入外部溶液中的DNA，而常态的细胞却不能，所以要转化质粒DNA进入大肠杆菌必须首先制备感受态的大肠杆菌细胞。 1、取1%大肠杆菌E.coli接种于含2ml LB培养基的试管中，37℃振荡培养过夜 2、取0.1ml过夜培养物转种于含10ml LB培养基的三角瓶中，37℃振荡培养3h至OD600=0.3 3、然后把培养物倒入1.5ml离心管中，冰浴10min。 4、在4℃下以4000rpm离心5min，去上清液 5、把菌体悬浮于15m1冰冷的0.1M CaCl2溶液中