磷脂脂肪酸土壤微生物群落分析程序PLFAEco.docVIP

磷脂脂肪酸土壤微生物群落分析 林营志, 苏明星, 傅秀荣, 张秋芳, 刘波 （福建省农业科学院农业生物资源研究所，福建福州350003） 摘要磷脂脂肪酸(PLFAs)是一个良好的生物标记，土壤微生物群落多样性的定性定量分析。为提高分析效率，MIDI公司Sherlock脂肪酸微生物鉴定系统的基础上编写了生物标记辅助分析PLFAEco，，Shannon-Wiener(H1)、Brillouin(H2)、McIntosh多样性指数(H3)、丰富度指数(S)、Pielou均匀度(J)、Simpson优势度指数(D)计算，聚类分析主成份分析。该软件具有操作方便、速度快的特点，能满足大多数情况下的需求，已在烟田土壤、发酵床养猪场垫料的微生物群落分析中得到了验证。 关键词土壤；微生物群落；磷脂脂肪酸Perl; R 文章编号： 中图分类号：S159.9; S126 文献标识码： The used for analysis of microbial community of soil samples with the biomark of the phospholipid fatty acids (PLFAs) Lin Yingzhi, Su Mingxing, Fu Xiurong, Zhang Qiufang, Liu Bo ( Institute of the Agricul