编号：农业微生物研究中心 [2015-11-30] 共23页.docVIP

编号：生物[2011-11-30] 共23页 承担单位：福建省农科院农业生物资源研究所 试验设计： 试验项目：Perl脚本开发：trimPE初版， 整合的质量修剪工具 试验人员：唐唯其 试验负责： 报告日期：2011-11-30 计数月份：2011年11月 研究资格系数 (0.5-1.0) 实验设计系数 （0.9-1.0） 报告得分 总分 实验设计 实验记载 实验分析 实验简报 实验文章 1-20% 21-40% 41-60% 61-80% 81-100% 1%-5% 设计，实施实验，记载，分析清晰，结论清晰文献完整，发表水平 农业微生物研究中心 电话: 0591 传真: 0591 试验目的 本文开发的trimPE是对高通量Paired-End测序进行质量修剪（Quality Trimming）的工具。 1.1 前言（背景） 测序过程中，每个碱基发生测序错误的概率，比如0.001，即千分之一，表示每1000个碱基中只有1个碱基可能发生测序错误。概率值可以通过公式转换成log值，换算成整数，即测序的质量值，一般称之为phred值。phred是一款在sanger测序中，常用的重叠群Contig拼接软件，因phred的普遍应用，称log质量值为phred值。 而在fastq文件中，为了表示方便，用ASCII码来表示phred