网格技术在生命科学中的应用研究.pdfVIP

生物技术通报 ·技术与方法· BIOTECHNoLoGYBULLETIN 2008年第1期 网格技术在生命科学中的应用研究 王繁业刘登 (青岛科技大学化工学院，青岛266042) 摘要： 生命科学尤其是生物信息学中庞大的数据处理和高性能计算大大超出了某一单个机构的计算能力，而网 格技术的出现使这些困难应刃而解，并逐渐成为生命科学标准的网络基础。从计算网格、数据网格和知识网格3个方面综 述了最新的网格技术。最后展望了网格技术在生命科学领域中广阔的应用前景。 关键词： 生物信息学计算网格数据网格知识网格 ResearchofGrid inLifeSciences Application Technology Liu WangFanye Deng Chemical Scienceand (Collegeof Engineering，Q嘞Universityof 266042) Technology，Qing如o data Abstract：Thelifesciences Bioinformatics and far especially huge processinghigh-performancecomputing thecalculationofa the of tothese舳culfiesshouldbladeand beyond sin西einstitution，andemergencegridcomputing becomethestandardofthelifesciencesnetworkinfimtructure．Thisreviewsthelatest solutions，andgradually paper grid the in i11thefield and three．In oflife technology劬mcomputing咖d，data咖dknowledgegdd short，gddtechnology sciencesdemonstratesbroad applicationprospects． words：Bioinformatics Data Key Computatingg=d gridKnowledgegrid 前言 表的数字处理。另一种是以序列匹配为代表的符号 生物信息学的应用通常需要高性能计算和大 处理。 量的数据处理，这些计算和处理都大大超出了单个 由于系统生物学的出现，高流通量数字处理在 机构的计算能力【11。例如一些生物学实验数据分析 生物信息学的分子、细胞、器官和个体的生物动力 以及基因组、转录子、蛋白质组和其他类型的一些 学模型方面有了相当广泛的应用，分子折叠、分子