EcoTILLING高通量分析甘蓝型油菜种质叶绿体rps16基因的多态性.pdfVIP

分子植物育种，2014年，第 12卷，第6期，第 1067—1076页 MolecularPlantBreeding，2014，Vo1．12，No．6，1067—1076 研究论文 ResearchArticle EcoTILLING高通量分析甘蓝型油菜种质叶绿体rpsl6基因的多态性 蔡梦鲜 ，2 乔江伟 - 闫贵欣 1吴金锋 李再云： 伍晓明 1中国农业科学院油料作物研究所，农业部油料作物生物学重点开放实验室，武汉，430062；2华中农业大学植物科学技术学院，武汉，430070 通讯作者，wuxm@oilcrops．cn 摘 要 叶绿体rpsl6基因作为叶绿体重要基因，广泛应用于植物系统发育研究，而甘蓝型油菜rps16基因 多态性研究尚未见报道。本研究利用二维EcoTILLING(ecotypetargetinginducedlocallesionsingenomes)技 术及 Sanger测序技术对全球256份甘蓝型油菜种质资源的rps16基因进行多态性分析。结果发现，256份甘 蓝型油菜 rps16基因有 5个多态性位点，经测序检测其存在 4种单倍型；5个 SNP位点都位于非编码序列 上。研究结果表明，rps16基因在不同材料 中具有丰富的遗传变异，可为其它基因遗传多样性研究提供借鉴， 有助于对油菜种质资源进行评估和多样性分类。 关键词 甘蓝型油菜，rps16基因，SNP，EcoTILLING High—throughputDiscovery ofChloroplastrpsl6 GenePolymorphismsin CollectionsofBrasssicanapusL．byEcoTILLING CaiMengxian。 QiaoJiangwei YanGuixin WuJinfeng LiZaiyun WuXiaoming 1OilCropResearchInstitute，ChineseAcademyofAgriculturalSciences，KeyLabOilCropGeneticImprovement，MinistryofAgriculture，W uhan， 430062；2HuazhongAgriculturalUniversity，CollegeofPlantSciencena dTechnology，Wuhan，430070 Correspondingauthor，wuxm@oilcrops．cn DOI：10．132710．mpb．012．001067 Abstract Asanimportantgene，therpsl whichislocatedinthechloroplastofplnat，iswidelyusedinphyloge— neticstudies．However，afew reportswhichwererelatedtohtepolymorphismsofrpsl6geneinBrassicanapus hadbeenrevealed．Inthepresentwork，bothtwo-dimensionalEcoTILLINGandSangerSequencingwereapplied todetectthepolymorphismsofrpsl6of256accessionsBrassieanapuscollectedacrosstheworld．Theresults indicatedhtat5polymorphicsites，allofwhichwerelocatedinnon—codingregion，nad4haplotypesweredetected in256accessionsofB．g／gp／~／．Thiswork demonstratedhtat therewasabundantgeneticdiversityofrpsl6gene bewteenthespecies．Theresultswouldfaciliattetoevaluateandclassifyaboutrapeseedgermplasm diversiyt，nad wouldprovideareferenceforothergeneticdiversiytstudiesaswel1． Keywords Brassicanapus，rpsl6gene，SNP，EcoTILLING 甘蓝型油菜 ．napus，2n=38，AACC)是 由基本 甘蓝型油菜具有丰富的种质资源，蕴含着极具 种 白菜 ．rapa,2n=20，AA)与甘蓝 ．oleracea,2n=