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人类基因组计划——从基因组到后基因组
金志强
(中国热带农业科学院热带作物生物技术国家重点实验室)
、/
摘嘉简要综述了人类基因组计划的产生背景、人类基因组研究的任务和进展以及后基因
组研究的基本概念和前景。
1人类基因组计划产生的背景
自70年代开始,人类致力于癌症的研究。在长达十余年的研究过程中,人们逐渐认识到人类
疾病的发生都与基因有着直接或间接的关系。于是,学术界出现了两种观点,一是仍然采用针对某
个疾病的“零敲碎打”的方法(piec{emealapproach)开展研究,另一种观点则认为必须从整体上研究和
分析整个人类基因组及其序列。持这种观点的诺贝尔奖获得者DulbeccoR于1986年3月7日在
V提出从整
Science上发表了一篇有关开展人类基因组计划的短文。同年,著名遗传学者Mckusick
个基因组的层次研究遗传学的学科称为“基因组学(Genomies)”。从此一门新兴的学科诞生了。
Genome
(Hunlan
元,并开始筹建实验室。1988年2月,美国国家科学研究委员会(NRC)的专家制定了“人类基因组
and thehuman
sequencing genome)”计划,阐述了HGP的研究内容。同年,美
的作图与测序(mapping
国成立了“国家人类基因组研究中心”,由著名科学家、DNA双螺旋结构的发现者Watson出任第一
任主任。历经5年的时间并伴随着各种争论,美国国会终于批准“人类基因组计划”于1990年10
月1日正式启动,总体计划是在15年内投入至少30亿美元进行人类全基因组的分析。世界其它
国家,例如英国、法国、德国和欧共体也先后启动了各自的HGP。
中国的HGP于1994年初启动。最初由国家自然科学基金委员会和“863”高科技计划支持,先
后启动了“中华民族基因组中若干位点基因结构的研究”和“重大疾病相关基因的定位、克隆、结构
与功能研究”。1998年科技部决定在北京和上海各成立一个中心,于10月份命名为中国南基因中
心,1999年在北京先后成立了中国科学院北京人类基因组中心和北方人类基因组中心。目前我国
人类基因组的研究已跻身于世界强国之列。
2人类基因组计划的任务及进展
HGP的任务可以用4张图谱来概括,即遗传图谱、物理图谱、序列图谱和基因图谱。遗传图谱
. ·39-
又称为连锁图。利用遗传标记把人类基因组分成不同的区域,可以利用连锁分析法找到某一致病
的或表现型的基因与某一标记(紧密连锁)的证据,即可把这一基因定位于这~已知区域,再对基因
进行分离研究。在HGP的研究过程中,遗传标记的研究也随之逐步深入。第一『弋的遗传标记是一
类经典的遗传标记,如ABO血型位点标记,HLA位点等。但由于已知多态的蛋白质很少,等位基因
的数目有限,且无法获得足够的信息量和检测技术的烦琐等因素,不能满足HGP中遗传分析的工
作.70年代中后期建立起来的RELP是从DNA上寻找的标记,这类标记在整个基因组中确定的位
点数目可达105以上.并被广泛应用于HGP中。但所提供的信息量仍十分有限。
1985年发现了“小卫星中心(minisatellite
coFe)”。在人类基因组中分布有大量的此类长度的多
of
numbertandom
态性标记,并存在于基因组的各个部位,这种数量可变的串联重复(variable repeats,
Tandom
Repeats)。这一标记系统使人类基因组的遗传制图与连锁分析发生了革命性的变化。1996
nucleotide
年又有一类新的SNP(singlepolymorphismt)的遗传标记系统被建立,称为第三代遗传标记系
统。这种标记系统在人类基因组中可达到300万个
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