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关于QST3优化TS的讨论 作者: goodmood660 ?? 收录日期: 2010-11-18 ?? 发布日期: 2010-11-11 FAQ中：（2.19）关于为什么使用QST3的时候必须优化反应物和产物？??Quote: 今天QQ上有个虫友找我，说做QST3计算，但是没有优化反应物和产物的构型，就用这种未优化的初始构型和终止构型计算了TS构型。课题基本做完了，问我这样行不行。我虽然很替他惋惜，但是我不得不说：“非常可惜，你的计算确实没有意义”QST2和QST3是基于QST过渡态理论的计算方法。这要从QST计算方法的原理上来讲一讲了。QST的原理如图【8-2】，A与B是势能面上两个“碗底”。我打算用QST方法找一个irc线。于是就先在A和B之间画一条直线，然后，逐步沿着这条直线上的垂线方向的力常数，开始偏移这条直线，直到找到一阶鞍点TS和合适的irc线。如果A和B的构型本身就没有被优化，如A和B这两个点，那么QST也将忠实的按照这条直线上的垂线方向的力常数，开始偏移这条直线，直到找到irc。但是，这个irc与irc是势能面上不同的线。irc和TS并不是ircTS。如果你的产物构型和反应物构型搭建的很不错，很接近优化后的构型，那么，如果你不优化产物构型和反应物构型，你也能得到合理的TS。比如图中的A和B。但是，你得到的irc仍旧是错的。讲述完毕。心情沉痛，教训啊，很替他惋惜！大家一定要引以为戒 我认为， QST3， QST2优化过渡态不优化反应物产物结构， 通常不会有问题， 做出的TS一般都是合理的， 直接用没问题。最后结构是否真正的过渡态， 要由频率计算确定，有一个虚频（同时后面的判据给出四个yes，证明是稳定点），就是过渡态。之后的IRC计算， 与QST2，QST3没有关系，而只与TS的频率计算有关。 所以不会是错的。有时直接用优化好的反应物和产物结构做QST2，反而是不可能成功的。 举个例子，1,2-二氯乙烯的顺，反异构化，直接给优化好的反应物和产物结构， 一定不行。 道理么， 做一下你就知道了。 作者：boylc789 不优化的话过渡态不好找吧~~ 作者：angel9280 您好！您是做量子化学的吗？我是搞有机合成的学生，能不能帮个忙呢？您能帮我用高斯软件做一下分子的模拟吗？红外，氢谱等的模拟。谢谢！期待您的回复！！！ 作者：manson1998 QUOTE: Originally posted by goodmood660 at 2010-11-11 09:51:28:FAQ中：（2.19）关于为什么使用QST3的时候必须优化反应物和产物？??Quote: 今天QQ上有个虫友找我，说做QST3计算，但是没有优化反应物和产物的构型，就用这种未优化的初始构型和终止构型计算了TS构型。课题基 ... 你可能没有做过百个原子以上的过渡态计算。虽然我个人也觉得完全优化R和P没有太大必要，但是对于初始给出的两个结构的优化是必须的，至少也要等到出了前两个yes。如果你直接拿两个未经优化的结构去做qst2，碰巧体系比较大的话，就是纯粹的浪费时间。再者找寻过渡态本身就是一个不断尝试的过程，尤其对于新体系。因此合理的减少时间是必要的，但不能忽视正确性。[ Last edited by manson1998 on 2010-11-11 at 15:39 ] 作者：goodmood660 QUOTE: Originally posted by manson1998 at 2010-11-11 15:36:20:你可能没有做过百个原子以上的过渡态计算。虽然我个人也觉得完全优化R和P没有太大必要，但是对于初始给出的两个结构的优化是必须的，至少也要等到出了前两个yes。如果你直接拿两个未经优化的结构去做qst2， ... 不在于原子数多少， 而在于分子的刚性和柔性有多大（构象问题）。100多原子的体系， 如果刚性较大， 不优化R，P，用直接猜的结构去做QST2，不会有困难。而且也谈不上浪费时间---经验多了， 猜的结构不会差很多的，计算时间不会更长。而且，你要是有足够资源，你就不用等R,P的优化结果，总的效率更高。 我做过7-80个原子的， 也做过120多原子的， 都这样做，没什么问题。 作者：3867826 QUOTE: Originally posted by goodmood660 at 2010-11-11 17:09:30:不在于原子数多少， 而在于分子的刚性和柔性有多大（构象问题）。100多原子的体系， 如果刚性较大， 不优化R，P，用直接猜的结构去做QST2，不会有困难。而且也谈不上浪费时间---经验多了， 猜的结构不会差 ... 还是要优化