偏分离分子标记的作图方法.pdfVIP

维普资讯 遗 传 HEREDITAS(Beijing)26(3)：356～358，2004 技 术 与 方 法 偏分离分子标记的作图方法 谭 军，薛庆中 (浙江大学农业与生物技术学院农学系，杭州 310029) 摘 要：对取 自MAPMAKER软件小鼠F 群体(含 333个体)的5个 RFLP连锁标记数据作了共显性分子标记偏 分离的分析 。先确定选择类型的方程组 (配子或合子)，随后采用 Newton—Raphson迭代法估算标记间的重组值。 在构建分子标记遗传图谱时，如果两个相邻标记均存在偏分离，最好采用纳入偏分离因子的估算方法 。在估计 F? 群体标记间偏分离重组距离上 ，用连续 !检测方法比传统 检测更为准确。 关键词 ：分子标记 ；遗传作 图；偏分离 中图分类号：Q343．17 文献标识码 ：A 文章编号：0253—9772(2004)03—0356—05 MappingbyM olecularM arkersShowingSegregationDistortion TAN Jun，XUEQing—Zhong (DepartmentoJAgronomy，CollegeofAgrhultureandl~iotechnology，Zh~iangUniversity，Hangzhou310029·China) Abstract：Thecomparativeanalysisofsegregationdistortionsofthecodominantmarkersdatapresentedinsoftware MAPMAKERaremade。wherefiveRFIPsmarkersinvolveinamouseF2populationwith333individuals．Thesue— cessive testbeginswiththedeterminationsofgameticorzygoticselectiontypes。followedbytheestimationofre— combinationfractionsbetweentwomarkerswiththeNewton—Raphson iterationmethod．ItisbettertOusethemo— lecularmarkershowingsegregationdistortionforconstructingageneticmap，inthecaseofseriouslyskew segrega— tionbetweenboththeadjoiningmarkers．Thesuccessive testprovidesbetteraccuracythanthatofclassical test fortheestimationoftherecombinationvaluesinF2populationwithsegregationdistortion． Keywords：molecularmarker；geneticmapping；segregationdistortion 24．5 ] 构建遗传图谱时，通常采用经典的最大似然法 。 导致偏分离的部分原因与配子或合子形 估算标记问的遗传距离。该算法的前提是符合孟德 成过程中所受到的选择有关 ，从而会对连锁分析产 尔遗传规律 ，标记不存在偏分离 。然而，杂种后代群 生严重影响口、。因此 ，探讨偏分离分子标记 的作 体 中分子标记偏分离现象已有报道。例如：在栽培 图方法已受到重视 引。 大豆与半野生大豆杂交 F 代重组 自