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刺铗细蜉(新种和逸仙丽翅蜉(新组合)线粒体基因组全序列的测定(昆虫纲:蜉蝣目).pdf
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刺铗细蜉(新种)和逸仙丽翅蜉(新组合)
线粒体基因组全序列的测定
(昆虫纲:蜉蝣目)
摘要
线粒体基因组序列及其结构在昆虫系统学中已得到越来越多的应用,而关于蜉
蝣基因组的报道却十分罕见。作为有翅昆虫中起源较早的一支,相信更多蜉蝣目物
种线粒体基因组的测定和结构重建可以为相关研究提供有用信息。
本研究测定了易获取的刺铗细蜉Caenispycnacanthasp.nov.(细蜉科Caenidae)
和逸仙丽翅蜉Alainitesyixiani
组全序列,并重建了它们的二级结构。由于这两科蜉蝣虫体一般较小、结构退化、
成虫与稚虫有时很难对应等原因,其分类地位一直存有争议。其本地代表种类线粒
体基因组的测定也许可以为系统学研究提供更多的线索和资料。
本研究所用材料均采自南京紫金山。在材料准备和物种鉴定过程中,发现细蜉
科一新种,我们将其命名为刺铗细蜉Caenispycnacantha
sp.nov.;并据标本认为逸
仙四节蜉Baetis comb.nov.。因其稚虫右
yixiani应该为逸仙丽翅蜉Alainitesyixiani
上颚的臼齿明显呈现为两根刺状、成虫后翅具3根纵脉,完全符合丽翅蜉属的属征。
PCR)和常规PCR扩增线粒体基因
本研究采用长距离聚合酶链式反应(Long
组后,通过PCR产物直接测序和克隆菌斑的测序策略,获得并分析了刺铗细蜉和
逸仙丽翅蜉线粒体基因组的结构及其序列特征,包括基因排列顺序、碱基组成、控
二级结构特征、基因的密码子使用及氨基酸组成等。结果显示:
1)刺铗细蜉和逸仙丽翅蜉线粒体全基因组均为双链环状分子,基因组序列分
别为15,351
bp和14,581bp,两个线粒体基因组均包含了与其他节肢动物一致的37
区。
2)在基因排列顺序上,刺铗细蜉线粒体基因组成与典型的后生动物线粒体DNA
trnQ与trnM之间,而且前者由B链倒位到c【链上。该特征在其他已测出的3种蜉
蝣目昆虫中并未发现。
3)两种蜉蝣线粒体蛋白质编码基因中,除刺铗细蜉的coxl基因使用TCG外,
摘要
其他所有基因都以ATN作为起始密码子。两种蜉蝣除刺铗细蜉的cytb基因存在1
个不完全的T外,都以1:从或TAG作为终止密码子。
4)刺铗细蜉和逸仙丽翅蜉基因组中22个tR_NA基因的反密码子与多数节肢动
物一样,二级结构也很保守,除逸仙丽翅蜉trnK和trnY缺失DHU臂外都可折叠成
典型的三叶草结构。
5)刺铗细蜉和逸仙丽翅蜉线粒体基因组的蛋白质编码基因、rKNA基因和
tRNA基因均存在很强的碱基A+T含量偏向性,整个线粒体基因组序列也存在很高
的A+T含量偏向性,其中控制区的A+T含量在两种中分别为73.9%、63.7%,这符
合昆虫mtDNA控制区碱基组成偏向性的特征。
关键词:细蜉科,四节蜉科,新种,刺铗细蜉,逸仙丽翅蜉,线粒体基因组全序列
abstract
The MitochondrialGenome of
Complete
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