刺铗细蜉(新种和逸仙丽翅蜉(新组合)线粒体基因组全序列的测定(昆虫纲:蜉蝣目).pdfVIP

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刺铗细蜉(新种和逸仙丽翅蜉(新组合)线粒体基因组全序列的测定(昆虫纲:蜉蝣目).pdf

f脚删胛脚舢删 rl 删删㈣ 摘要 Y 1|7lHii2iu16Ifl 024 刺铗细蜉(新种)和逸仙丽翅蜉(新组合) 线粒体基因组全序列的测定 (昆虫纲:蜉蝣目) 摘要 线粒体基因组序列及其结构在昆虫系统学中已得到越来越多的应用,而关于蜉 蝣基因组的报道却十分罕见。作为有翅昆虫中起源较早的一支,相信更多蜉蝣目物 种线粒体基因组的测定和结构重建可以为相关研究提供有用信息。 本研究测定了易获取的刺铗细蜉Caenispycnacanthasp.nov.(细蜉科Caenidae) 和逸仙丽翅蜉Alainitesyixiani 组全序列,并重建了它们的二级结构。由于这两科蜉蝣虫体一般较小、结构退化、 成虫与稚虫有时很难对应等原因,其分类地位一直存有争议。其本地代表种类线粒 体基因组的测定也许可以为系统学研究提供更多的线索和资料。 本研究所用材料均采自南京紫金山。在材料准备和物种鉴定过程中,发现细蜉 科一新种,我们将其命名为刺铗细蜉Caenispycnacantha sp.nov.;并据标本认为逸 仙四节蜉Baetis comb.nov.。因其稚虫右 yixiani应该为逸仙丽翅蜉Alainitesyixiani 上颚的臼齿明显呈现为两根刺状、成虫后翅具3根纵脉,完全符合丽翅蜉属的属征。 PCR)和常规PCR扩增线粒体基因 本研究采用长距离聚合酶链式反应(Long 组后,通过PCR产物直接测序和克隆菌斑的测序策略,获得并分析了刺铗细蜉和 逸仙丽翅蜉线粒体基因组的结构及其序列特征,包括基因排列顺序、碱基组成、控 二级结构特征、基因的密码子使用及氨基酸组成等。结果显示: 1)刺铗细蜉和逸仙丽翅蜉线粒体全基因组均为双链环状分子,基因组序列分 别为15,351 bp和14,581bp,两个线粒体基因组均包含了与其他节肢动物一致的37 区。 2)在基因排列顺序上,刺铗细蜉线粒体基因组成与典型的后生动物线粒体DNA trnQ与trnM之间,而且前者由B链倒位到c【链上。该特征在其他已测出的3种蜉 蝣目昆虫中并未发现。 3)两种蜉蝣线粒体蛋白质编码基因中,除刺铗细蜉的coxl基因使用TCG外, 摘要 其他所有基因都以ATN作为起始密码子。两种蜉蝣除刺铗细蜉的cytb基因存在1 个不完全的T外,都以1:从或TAG作为终止密码子。 4)刺铗细蜉和逸仙丽翅蜉基因组中22个tR_NA基因的反密码子与多数节肢动 物一样,二级结构也很保守,除逸仙丽翅蜉trnK和trnY缺失DHU臂外都可折叠成 典型的三叶草结构。 5)刺铗细蜉和逸仙丽翅蜉线粒体基因组的蛋白质编码基因、rKNA基因和 tRNA基因均存在很强的碱基A+T含量偏向性,整个线粒体基因组序列也存在很高 的A+T含量偏向性,其中控制区的A+T含量在两种中分别为73.9%、63.7%,这符 合昆虫mtDNA控制区碱基组成偏向性的特征。 关键词:细蜉科,四节蜉科,新种,刺铗细蜉,逸仙丽翅蜉,线粒体基因组全序列 abstract The MitochondrialGenome of Complete

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