《不同基因型丙型肝炎病毒E1、E2蛋白生物信息学分析-论文》.pdfVIP

南 昌大学学报 (医学版)2014年第 54卷第 7期 JournalofNanchangUniversity(MedicalSciences)2014，Vo1．54No．7 17 不 同基 因型丙型肝炎病毒 E1、E2蛋 白生物信息学分析 李晓瑶 ，邹淑慧 ，夏方娜 ，杨小平 ，余克花 ，刘金辉 (南昌大学a．公共卫生学院临床全科 101班；b．医学院微生物学教研室，南昌330006) 摘要 ：目的 对不同基因型的丙型肝炎病毒(HCV)的E1、E2蛋白进行生物信息学比较分析，以找出重要的生物 信息学数据 。方法 从 GeneBank中获取不同基因型 HCV 的E1、E2蛋 白核苷酸与氨基酸序列，运用 DNAStar， ClustalX，BioEdit等国际通用的软件进行氨基酸和核苷酸 的序列 比对 ，计算核苷酸和氨基酸 同源性 。在线软件 TMHMM v2．0分析 E1、E2蛋 白跨膜 区。AntheProt5．0软件分析二级结构 。结果 E1氨基酸起始于 aa193一aa 196和终止于aa382一aa383，E2蛋 白氨基酸起始于 aa384和终止于 aa744