人葡萄膜黑色素瘤组织中差异表达基因及相关代谢通路的分析.pdf

·996· ·实验研究· 人葡萄膜黑色素瘤组织中差异表达基因及相关 代谢通路的分析 杜葵芳 顼晓琳 李洋 王盈之魏文斌 【摘要】 背景人葡萄膜黑色素瘤(UM)组织与正常组织中存在差异表达基因，但国外不同文献报道的 结果不尽一致，而国内对人UM基因表达的改变及其相关的作用通路的研究较少。 目的 应用基因芯片技 术探讨人UM中差异表达的基因，分析差异基因参与的重要信号通路。方法 收集在北京同仁医院因原发 性UM行眼球摘除并经组织病理学证实为梭形细胞型UM的组织标本4例，以正常供体葡萄膜组织作为对照 GenomeU133Plus 组。利用Human 2．0芯片技术筛查2种组织中基因表达的差异，并使用GOEAST富集分析 软件对差异基因的重要生物学功能及参与的通路进行分析。 结果 与正常的葡萄膜组织对比，人UM中有 4165个差异基因，占12．50％，其中包含1236个上调基因和2929个下调基因，分别占3．71％和8．79％。人 UM组织中上调5倍或以上基因为113个，下调50％的基因为l053个；上调lO倍或以上的基因为21个，下调 90％或以上的基因为422个；上调50倍或以上的基因为1个，下调98％或以上的基因为33个；上调100倍或 以上的基因为1个，下调99％或以上的基因为5个。按功能学分类表明，差异表达基因中包括细胞分化与增 生基因、发育相关基因、细胞黏附相关基因、免疫应答基因、调节转录基因、信号转导相关基因、凋亡以及抗凋 亡相关基因等；差异表达基因参与的代谢通路涉及血管形成过程的代谢通路、细胞周期相关的蛋白激酶通路 以及B淋巴细胞或T淋巴细胞的代谢通路等。结论 人UM组织与正常人葡萄膜组织中基因表达谱明显不 同，这些差异表达的基因除参与血管生成、激酶通路等已知的UM发育有关的代谢通路外，还涉及免疫系统的 变化。人UM的发生和进展是多种基因、多种通路共同作用的结果。 【关键词】 黑色素瘤／基因；葡萄膜肿瘤；基因表达谱；肿瘤基因表达调控；基因组学／方法；聚类分 析；表达谱芯片；人 of in melanomaDu andmetabolic humanuveal Analysisdifferentiallyexpressedgenes pathways Ku洳ng，Xu Medical Xiaolin，LiyⅡ增，WangYingzhi，WeiWenbin．DepartmentofOphthalmology，BeijingTongrenHospital，Capital University，Be扰ng100069，China author：WeiWenbin，Email：tr—weiwenbin@163．con Corresponding Studies thereexsits in humanuveal showedthat differential [Abstract】Background geneexpression relevant isstill resultsaresomewhat literature melanoma(UM)．However，theresearching inconsistentlyabroad，while inChina．Fewdomesticresearcheshave levelorthe of less theabnormal