豌豆属（Pisum）SSR标记遗传多样性结构鉴别与分析.pdfVIP

中国农业科学 2009,42(1):36-46 Scientia Agricultura Sinica doi: 10.3864/j.issn.0578-1752.2009.01.005 豌豆属（Pisum）SSR标记遗传多样性结构鉴别与分析 1 2 3 1 1 宗绪晓 ，Rebecca Ford ，Robert R Redden ，关建平 ，王述民 1 2 （中国农业科学院作物科学研究所/ 国家农作物基因资源与基因改良重大科学工程，中国北京 100081 ；BioMarka, Faculty of Land and Food Resources, 3 The University of Melbourne, Melbourne, Australia 3010 ；Australian Temperate Field Crops Collection, Grains Innovation Park, The Department of Primary Industries, Private Bag 260, Horsham, Australia 3401 ） 摘要： 【目的】评价豌豆属（Pisum L.）2 个种 5 个亚种下，共 8 个资源类群的遗传多样性水平，揭示豌豆 属下资源群体结构及其遗传关系远近，验证传统植物学分类的可靠程度，为充分发掘、利用豌豆野生种质提供必 要信息。【方法】利用21对豌豆多态性SSR引物，对来自世界5大洲62个国家的豌豆属94份栽培种质（ P. sativum ssp. sativum var. sativum ）及其1个近缘野生种（P. fulvum ），3个野生亚种（P. sativum ssp. abyssinicum、 P. sativum ssp. asiaticum、P. sativum ssp.transcaucasicum）和3个野生变种（P. sativum ssp. elatius var. elatius、P. sativum ssp. elatius var.pumilio、P. sativum ssp.sativum var.arvense ）的 103 份野生种质 进行SSR标记遗传多样性分析；利用NTSYSpc2.2d软件估算其遗传距离，进行主成分分析（PCA）并绘制三维空间 聚类图；利用 Popgene V1.32 估算种质群间的 Nei78 遗传距离等参数并进行 UPGMA 聚类分析，采用 MEGA3.1 绘制 种质群间聚类图；采用Popgene V1.32估算种质群的等位位点分布等参数，利用Fstat V进行种质群间遗 传多样性差异显著性测验。【结果】21对豌豆多态性SSR 引物共扩增出104条多态性带，每对引物平均扩增出4.95 个等位变异，其中有效等位变异占 65.56%；PSAD270，PSAC58，PSAA18，PSAC75，PSAA175 和 PSAB72 等 SSR 引物 最为有效。SSR 等位变异在豌豆属植物学分类单位中分布均匀，但分类单位种质群间的遗传多样性在多数情况下 差异显著。豌豆属野生种 P. fulvum 的遗传多样性远低于栽培种 P. sativum；豌豆栽培种下，P. sativum ssp. sativum var. sativum 和 P. sativum ssp. asiaticum 的遗传多样性最高，P. sativum ssp. elatius var. elatius 和 P. sativum ssp. transcauca