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山羊瘤胃微生物基因组文库的构建及功能基因的筛选
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Y1735072
摘要
自然界中存在着大量的微生物,能够在实验室中纯培养的种类微乎其微,这就大
大限制了人们对微生物的研究。宏基因组学可以在非实验室纯培养的条件下直接获取
环境微生物DNA,对其基因组进行分析并将其克隆到合适的载体上,筛选所需要功
能基因。为了研究山羊瘤胃微生物菌群降解纤维素酶的功能,本试验利用宏基因组学
kb
技术,从山羊瘤胃液中提取混合微生物DNA,经BamHI部分酶切后得到50~800
coli
BAC载体上,转化EEPl300,建立山羊瘤胃微
的DNA片段,将其连接到pCCl
I酶切后,经RFLP分析,该文库平均
生物BAC文库,共获得12672个克隆。用Not
插入片段为61
叶苷为底物的检测平板,进行B.葡萄糖苷酶的高通量功能筛选,获得了16个B.葡萄
I对
糖苷酶阳性克隆,对其中一个具有较高活力的阳性克隆进行深入分析,用Sau3A
阳性克隆进行部分酶切后,回收2~5 19载体上。转
kb之间片段进行回收连接到pUC
化到EcoliDH5a感受态细胞中,得到的阳性克隆,将其挑出培养成菌液,送至上海
基因组的纤维素酶基因。
关键词:山羊,瘤胃微生物,宏基因组文库,构建
Abstract
not which
Mostofthemicrobesin environmentsare culturable
presentmany readily
limits librarieswereconstructed
theresearchof directly
microorganism.Metagenomeby
and
DNAfromenvironmentaland to host
extracting sampletransformingsurrogate
,.
novelfunction orderto theeffectofthe ofcellulose
screening genes.In study degradation t
lumen mixe
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