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薏苡遗传图谱的建及重要性状qtl定位的研究
摘要
薏苡是玉米的近缘种,二者亲缘关系比较近。在起源于亚洲的玉蜀黍族的植物中,
薏苡被认为最有可能是玉米的祖先。薏苡偏向于野生,具有很多优良性状,诸如耐寒、
抗虫、根系发达等。我国薏苡资源丰富,被公认为是世界薏苡的重要起源地之一。但是,
薏苡无论是在国内还是在国外都缺少系统的分子遗传学研究。分子标记技术的发展,为
利用分子标记技术开展薏苡的遗传图谱构建、数量性状QTL定位、比较基因组研究创造
了条件,这对于开发薏苡基因资源,玉米的遗传改良,以及深入研究玉米的起源进化均
具有重要意义。
本研究的目的是,利用北京薏苡和武汉薏苡组配的F2群体为定位群体,在本实验室
已经建立的AFLP标记连锁图谱的基础上,以RFLP标记为主,进一步加密薏苡的分子标
记连锁图谱;在两年一点田间试验基础上,利用分子标记定位慧苡重要农艺性状QTL和
分析它们的遗传效益;同时探讨利用RFLP标记,开展薏苡和玉米的比较基因组研究。
本研究的主要结果如下:
除了39个模糊不清其余均能获得较好的杂交结果,最终用于群体定位的29个,扣除不
能读带的标记。多态性比侈920%。其中在同为玉米探针的情况下,cDNA探针的多态性比
稻的(25%)高于玉米的(21.92%)。29个探针中有2个为显性,x2测验在概率0.01
水平5个表现偏分离,比例为17.2%;总基因型统计母本基因型比例、杂合基因型比例、
父本基因型比例分别为28.16%、47.92%、23.92%。x2测验在概率0.01水平符合1:2:
l的理论比例。
的扩增产物表现较高的非特异性,近5饿的扩增产物无多态性。仅有4对引物扩增出特
异性较强且有多态性的带型,3个表现为共显性,1个为显性,x2测验均符合理论预期
比例。
连锁图,共划分为11个遗传连锁群。其中两个RFLP标记划在单独的一个群里。整个图
cM/Marker。
记分布于11个连锁群中,最多一个连锁群含有4个RFLP标记。
4.株高、叶长、叶宽、雄穗长和茎粗5个农艺性状的统计分析:2年数据方差分
析表明,茎粗差异不显著,株高、叶长、叶宽和雄穗长差异极显著:正态分布检验在第
一年中茎粗不符合正态分布,在第二年中叶长、叶宽不符合正态分布:在第一年中.叶
长、叶宽、株高和雄穗长符合正态分布,在第二年中株高、茎租和雄穗长符合正态分布;
2年间5个数量性状株高、叶长、叶宽、雄穗长和茎粗相关系数分别是0.785、0.820、
0.700、0.313和0.737。
5.运用WinQTLCart软件复合区间作图法对株高等5个数量性状进行了QTL扫描,
共定位31个QTL位点:茎粗8个、株高3个、雄穗长6个、叶长7个、叶宽7个,所
能解释的表型变异的方差最小的为12.16%,最大的为64.39%。两年问共同检测到的QTL
一共10个:茎粗3个,两年所能解释的表型变异的方差最小和最大分别为21.15%与
32.5l%:株高1个,两年所能解释的表型变异方差分别是37.39%和56.12%:叶长4
个,两年所能解释的表型变异方差最小和最大的分别为55.7%和62.62%:叶宽2个,
两年所能解释的表型变异方差分别是31.65%、50.24%和31.2%、50.69%。
6.基于RFLP探针的杂交位置和拷贝数的异同,开展薏苡和玉米的比较基因组研究:
在统计的杂交的60个探针中,23.33%探针在薏苡基因组上杂交表现为多拷贝,而在玉
拷贝,而在玉米中表现为2个拷贝。薏苡一个连锁群上的3个RFLP标记的位置与玉米
对应的1个染色体可能存在同线性关系,但发生了倒位。另外有两个在玉米染色体上连
锁的RFLP标记,染色体位置均为6.05,遗传距离21.7cM,在慧苡连锁群上表现连锁更
紧密,遗传距离只有1.1aM。
关键词:惹苡玉米分子标记QTL遗传连锁图
2
Abstract
of hasacloserelative
tothe tribe family,which
Coix Maydeae grass
belongs
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