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第一节 转录的基本特征 转录 ( transcription ) —— 生物体以DNA为模板合成RNA的过程 转录的基本特征 1、选择性转录 指细胞在不同的生长发育阶段,根据生存条件和代谢需要转录表达不同的基因,因而表达的只是基因组的一部分。 启动子(promoter):指RNA聚合酶识别、结合和启动转录的一段DNA序列,具有方向性。 终止子(terminator):DNA上与转录终止有关的序列。 增强子:能使与其临近的基因转录频率明显增加的DNA序列。 有义(+)链/编码链:在序列上与转录生成的RNA序列一致;一般报道的基因序列是此链的序列; 反义(-)链/模板链:作为转录的模板; 上游和下游:5’端一侧为上游,3’端一侧为下游;以编码链为准; 第二节 RNA聚合酶 1、共同特点: (1)直接合成,不需引物 (2)只转录模板链 (3)按碱基配对原则,忠实转录模板序列 (4)5’ →3’方向合成 (5)连续的过程 (6)可识别转录终止信号,终止转录 (7)无水解酶活性,无校对功能,错配率高 (8)可与基因表达调节蛋白相互作用,调控基因表达 第三节 与转录有关的调控序列 一、原核生物基因的启动子 Sextama框(-35序列):RNA聚合酶识别位点。 Pribnow框(-10序列):RNA聚合酶牢固结合位点。 两区相隔17nt时启动效率最高 三、原核生物基因的终止子 终止信号存在于RNA聚合酶已经转录过的序列之中。 分类:不依赖蛋白因子的终止作用; 依赖于蛋白因子的终止作用; 结构特点:在终止点之前有一段重复序列,两个反向重复部分(7~22bp)之间有一段不重复区段隔开,导致转录后产生茎环结构。 Two types of terminators in E. coli 终止效率与二重对称序列和寡聚U的长短有关,长度 效率 依赖?因子的终止 三、真核生物基因的终止子 1、mRNA:加尾信号:加尾位点 2、rRNA:18bp终止序列 3、tRNA:茎环结构等 第四节 原核生物RNA的合成 起始 延长 终止 后加工 一、转录起始 1、结合 RNA聚合酶全酶通过σ因子与启动子结合,形成闭合复合物 2、解链 RNA聚合酶全酶向下游移动,从-10区开始将DNA解开约17bp,形成开放复合物 3、合成 在RNA聚合酶作用下发生第一次聚合反应 5’-pppG -OH + NTP –? 5’ -pppGpN – OH + ppi 4、释放 合成8-9nt的RNA片段后, σ因子脱落,导致核心酶构象改变 二、转录延长 1、σ因子解离, RNA – pol 聚合酶核心酶变构,与模板结合松弛,沿着编码链5’→3’移动; 2、转录泡:DNA解链部分保持17bp,DNA-RNA杂交链维持约8bp; 3、DNA前方不断解链,后方重新缔合双链;新生的RNA链从杂交链中解离; 三、转录终止 ------ RNA聚合酶在DNA模板上停止前进,转录产物RNA链从转录复合物上脱落下来 四、转录后加工 原核生物的mRNA一经转录,通常立即进行翻译,除少数例外,一般不进行转录后加工。 原核生物的tRNA和rRNA都要经过一系列加工才能成为有活性的相应RNA。 第五节 真核生物RNA的合成 真核生物转录与原核生物转录的区别: 1、染色质和核小体结构对转录有深刻影响。 2、真核细胞RNA聚合酶高度分工。 3、转录的正常进行,除了需要RNA聚合酶以外,还需要许多被称为转录因子的蛋白质因子的参与。 4、启动子以外的序列参与调节基因的转录。 5、真核细胞内转录与翻译不存在偶联关系。 6、真核生物的转录产物多为单顺反子。 一、转录起始 真核生物的三种RNA聚合酶都不能单独转录基因,需要转录因子协助 TFIID是唯一能识别并结合TATA框的转录因子 二、转录延长 真核生物基因的转录延长与原核生物基因基本相同 TFIIF始终与转录复合物结合 转录延长因子参与 三、转录终止 真核生物mRNA转录终止与加尾同步进行 (一)mRNA前体 mRNA前体的平均长度是成熟mRNA的4-5倍 代谢速度快,半衰期短 (5-15分钟) 只有少部分加工成为成熟mRNA mRNA前体的加工方式主要有加帽、加尾、剪接、编辑和修饰 1、加帽(7-甲基鸟苷,倒扣一个“G” ) 5’端帽子结构:第一个核苷酸是7-甲基鸟苷酸m7G,通过5?-羟基与第二个核苷酸的5‘-羟基以5’,5’三磷酸酯键在原初mRNA的5’端与pppA或pppG相连,即 5?m7GpppGp — ( NTP ) n 帽子的作用 参与5外显子剪接 参与mRNA向细胞核外转运 是真核生物核糖体40S小亚基的识别和结合位点,参与蛋白质合成起始
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