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分子诊断技术.ppt
分子诊断技术 常见的核酸分子诊断技术 核酸分子杂交 ( Nucleic acid molecular Hybridization) 基因芯片( Gene Chip ) 聚合酶链反应( polymerase chain reaction reaction;PCR) 核酸分子杂交的原理 双链核酸加热或经硷处理变性后,可解链成两条互补的单链核酸。 在适当温度、盐浓度下,双链能按硷基互补配对原则(A-T,C-G)复性而重新成为双链核酸。 用已知序列的单链核酸,经标记制成核酸探针,与变性后的待测标本核酸进行杂交,通过检测标记探针的信号,可判断标本是否存在与探针互补杂交的同源核酸。 核酸分子杂交探针的制备 制备探针的靶核酸可通过: 分离、切割病毒的特定核酸片段获得; 用重组技术,将该片段克隆到细菌质粒,经扩增和纯化大量获得; 选择已知病毒的一段基因序列,用人工方法合成寡核苷酸,其长度以20个左右最为常用,过短易出现非特异性杂交。 核酸分子杂交探针的制备 常见的用于标记探针的示踪物质 放射性核素如:32P,35S,3H,125I等,杂交后可通过放射自显影技术进行检测 非放射性物质如:生物素、地高辛和酶等,杂交后可通过底物显色、化学发光等技术进行检测 核酸分子杂交示意图 核酸分子杂交的程序 常用的核酸分子杂交技术 斑点杂交(spot blot hybridization) 凝胶电泳印迹转移杂交(Southern blot hybridization) 原位杂交(in-situ hybridization) 斑点杂交 凝胶电泳印迹转移杂交 原位杂交(Southernblot hybridization) (in-situhybridization ) 核酸分子杂交技术的应用 核酸分子杂交具有很高的灵敏度和高度的特异性,因而该技术在分子生物学领域中已广泛地使用于克隆基因的筛选、酶切图谱的制作、基因组中特定基因序列的定性 等 在医学上,目前已用于多种遗传性疾病的基因诊断,恶性肿瘤的基因分析,传染病病原体的检测等领域中 。 基因芯片 基因芯片技术原理 大规模集成的固相杂交 基本原理是核酸分子杂交,即依据DNA双链碱基互补配对、变性和复性的原理 基因芯片的作用原理 基因芯片的制作方式 基因芯片技术流程 基因芯片的应用 基因表达分析 分析基因表达时空特征 基因差异表达检测 发现新基因 大规模DNA测序 基因型、基因突变和多态性分析 疾病的诊断与治疗 遗传病相关基因的定位 肿瘤诊断 感染性疾病的诊断 耐药菌株和药敏检测 聚合酶链反应(polymerase chain reaction reaction;PCR) PCR是八十年代中期问世的一种体外模拟体内DNA复制过程的技术,可在短时间内将待测特异性DNA扩增百万倍以上,并具有简单、快速、特异的特点,成为分子生物学发展史的又一个里程碑。 PCR不仅可检测各种DNA病毒的核酸,还可经过逆转录,检测各种RNA病毒的核酸,因而在各型肝炎病毒的检测中,敏感性远超过分子杂交,有着不可替代的作用。 PCR 的常见类型 常规PCR 逆转录PCR(RT-PCR) 巢式PCR〔nested-PCR〕 原位PCR(in-situ PCR) 多重PCR ??… 实时荧光定量PCR荧光检测技术 SYBR Green I。是一种结合于所有dsDNA双螺旋小沟区域的具有绿色激发波长的染料。 TaqMan 水解探针。由产荧光基团,荧光淬灭基团,与扩增子有互补的特异核苷酸序列组成。 实时荧光定量PCR:水解探针法 TaqMan法应用 起始模板的定量 基因型分析 目的基因定量 产物鉴定 单核苷酸多态性(SNP)分析 Think You * * Dot Bolt Hybridization for HBV DNA Quantitationin 5 μl of Patient Sera 基因芯片(或DNA Chip,或Microarray)又称DNA微阵列,是指固定在固相载体上的高密度DNA微点阵。即将大量靶基因或寡核苷酸片段有序地,高密度地(点与点间距一般小于500μm)排列在玻璃、硅等载体上,称之为基因芯片。 上图显示大量的DNA探针,按照一定的规律有序地排列在支撑物上,每个探针与相对应的特异互补序列结合后,即可发出荧光。利用该芯片可同时获取大量信息。 DNA Microarray 以大量已知序列的寡核苷酸、cDNA或基因片段作探针,检测样品中哪些核酸序列与其互补,然后通过定性、定量分析得出待测样品的基因序
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