高分辨率溶解曲线简介.docx

 PAGE \* MERGEFORMAT 8 高分辨率溶解曲线简介 ?INCLUDEPICTURE \d "/blog7style/images/common/sg_trans.gif" \* MERGEFORMATINET (2011-09-01 11:30:50) INCLUDEPICTURE \d "/blog7style/images/common/sg_trans.gif" \* MERGEFORMATINET 转载▼ 标签：?  HYPERLINK "/?c=blog&q=%D4%D3%CC%B8&by=tag" \t "/s/_blank" 杂谈高分辨率熔解曲线分析技术（ High Resolution Melting ），简称 HRM ，是近年来兴起的一种检测基因突变、进行基因分型和SNP检测的新工具，可以迅速的检测出核酸片段中单碱基的突变。 HRM 技术因其速度快，操作简便，高通量，灵敏性特异性高，对样品无污染等优点而被迅速的应用在生命科学、医学、农学、畜牧业等领域的研究工作中。其中，主要的研究方向集中在： 1 、基因未知突变以及 SNP 的扫描； 2、已知突变及 SNP 的基因分型； 3、动植物、微生物等物种的物种鉴定以及品种鉴定； 4 、法医鉴定、亲子鉴定； 5 、HLA 的配型； 6 、甲基化的研究等。 一、HRM?技术的基本原理： ????HRM 技术主要是基于核酸分子物理性质的不同。不同核酸分子的片段长短、 GC 含量、 GC 分布等是不同的，因此任何双链 DNA 分子在加热变性时都会有自己熔解曲线的形状和位置。 HRM 技术的基本原理就是根据熔解曲线的不同来对样品来进行区分。 ???以二倍体细胞为例，当纯和子样品通过 PCR 扩增，经过变性复性后，仍然是纯合子，如图一 A 。而杂合子 PCR 扩增完，经过变性复性后，样品中会形成部分的含有非沃森 - 克里克配对的双链分子存在。? 图一： A ：纯合子样品 　　　　　　　　　　　　　　　　　　B ：杂合子样品 ????如图一 B 所示，杂合子样品扩增后，经变性复性，会有非配对碱基的形成，而纯合子样品没有。这样，杂合子样品相对纯合子样品来说，双链不够稳定，表现在解链温度上就会有微小的差别。如果采用高分辨率的仪器进行检测，并用专门的软件进行分析，微小的差别就会被检测出来，从而成功的筛选出纯合子与杂合子。 下图是杂合子样品熔解曲线的的示意图： ?INCLUDEPICTURE \d "http://1872./images/blog/2010/7/9/13/23/12a68eeaad7g214.jpg" \* MERGEFORMATINET  ? 图二：杂合子样品的熔解曲线为四种不同双链的熔解曲线的叠加的结果。 ????以二倍体细胞为例，杂合子扩增后通过变性复性会形成二种同源双链和两种异源双链的混合物，在熔解过程中四种链会形成一条独特的溶解曲线，从而与纯合子的熔解曲线区分出来。 ???下图是采用 Lightscanner 仪器对纯合子，杂合子，双杂合样品的分析结果 INCLUDEPICTURE \d "http://1872./images/blog/2010/7/9/13/24/12a68ef936fg215.jpg" \* MERGEFORMATINET  ????图三 . 采用 Lightscanner 系统对标准样品的分析。灰色的曲线代表的是纯合子样品，红色的曲线代表的是杂合子样品，蓝色的曲线代表的是双杂合样品，通过 Lightscanner 系统的分析，三种样品被明显的分为了三类，表现出了极高的灵敏性和准确性。 二、?HRM?技术的必备条件： HRM 技术走向实践应用主要基于两种技术的改进 : 1、双链 DNA 嵌入型饱和荧光染料 LCGreen 的开发； ????采用饱和的荧光染料是进行 HRM 分析的必备条件之一。 LCGreen 是饱和的荧光染料，与传统的荧光染料 Sybr Green 相比有如下优点： LCGreen 染料在 PCR 时可以以饱和的浓度加入，不会抑制 PCR 反应而Sybr Green 染料浓度过高会抑制 PCR 反应。在进行 HRM 分析时，由于饱和染料占据了 DNA 双链上每一对碱基上的空位，所以在双链解链时，染料立即与双链脱离，使得荧光信号发生较大的变化，而非饱和染料常发生位置上的迁移，从而对荧光信号没有大的影响。图四 A 所示，饱和染料可以占据 DNA 双链的每个碱基对，非饱和染料只能与部分碱基对结合。当熔解发生的时候， DNA 双链首先会有局部双链发生解链。采用 LCGreen 染料时，染料立即从 DNA 双链上发生脱离，造好较大的荧光值的改变，而 Sybr Green