蛋白与核酸的分析工具http.docVIP

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蛋白及核酸分析工具/tools/ (1)此网页的包括了预测跨膜结构的 TMHMM - Prediction of transmembrane helices in proteins (CBS; Denmark) http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM-2.0/ 预测跨膜区以及跨膜方向的 TMpred - Prediction of transmembrane regions and protein orientation /software/TMPRED_form.html (2)蛋白质一级结构预测Primary structure analysis ?ProtParam - Physico-chemical parameters of a protein sequence (amino-acid and atomic compositions, isoelectric point, extinction coefficient, etc.) (蛋白序列的化学参数包括氨基酸、原子组成、等电电、消光系数等) ?Compute pI/Mw - Compute the theoretical isoelectric point (pI) and molecular weight (Mw) from a UniProt Knowledgebase entry or for a user sequence (计算理论上的等电点和分子重) ?ScanSite pI/Mw - Compute the theoretical pI and Mw, and multiple phosphorylation states (计算理论上的等电点和分子重和多磷酸化状态) ?MW, pI, Titration curve - Computes pI, composition and allows to see a titration curve (计算理论上的等电点和组成,可以看滴定曲线) ?Scratch Protein Predictor ?HeliQuest - A web server to screen sequences with specific alpha-helical properties (一个网站利用专门的alpha螺旋扫描蛋白) ?Radar - De novo repeat detection in protein sequences (蛋白序列的重头重复检测) ?REP - Searches a protein sequence for repeats (利用重复子搜索蛋白) ?REPRO - De novo repeat detection in protein sequences (蛋白序列的重头重复检测) ?TRUST - De novo repeat detection in protein sequences (蛋白序列的重头重复检测) ?XSTREAM - De novo tandem repeat detection and architecture modeling in protein sequences (蛋白序列的串联重复检测和体系结构建模) ?SAPS - Statistical analysis of protein sequences at EMBnet-CH [Also available at EBI] (蛋白统计分析) ?Coils - Prediction of coiled coil regions in proteins (Lupass method) at EMBnet-CH [Also available at PBIL] (蛋白卷曲螺旋预测) ?Paircoil - Prediction of coiled coil regions in proteins (Bergers method) (蛋白的卷曲螺旋预测) ?Paircoil2 - Prediction of the parallel coiled coil fold from sequence using pairwise residue probabilitis with the Paircoil algorithm. (平行的卷曲螺旋折叠预测) ?Multicoil - Prediction of two- and three-stranded coiled coils (二到三股卷曲螺旋预测) ?2ZIP - Prediction of Leucine Zippers (亮氨酸拉链预测) ?ePESTfind - I

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