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CASTEP概述和一PPt详细教程.ppt
用第一原理预测AlAs的晶格参数 本指南主要是阐明在Materials Studio当中如何运用量子力学来测定物质的晶体结构。你将从中学到如何构建晶体结构以及如何设置CASTEP几何优化运行和分析结果。 本指南的内容如下: 1构建AlAs的晶体结构 2设置和运行CASTEP中的计算 3分析结果 4比较实验数据和结构 注意 如果你的服务器没有足够快的CPU,本指南限制使用CASTEP进行几何优化计算,因为它会占用相当长的时间。 1 构建AlAs的晶体结构 为了构建晶体结构,我们需要知道你想要构建的晶体的空间群信息,晶格参数以及它的内部坐标。以AlAs为例,它的空间群是F-43m或空间群数字是216。它有两种基本元素Al和As ,其分数坐标分别为(0 0 0)和(0.25 0.25 0.25)。它的晶格参数为5.6622埃。 第一步是构建晶格。在Project explorer的跟目录上右键单击,选中New | 3D Atomistic Document。接着在3D Atomistic Document右键单击,把它更名为AlAs。 从菜单中选择Build | Crystals | Build Crystal,然后显示出Build Crystal对话框,如下: 一个没有原子的晶格就在3D model document中显示出来。现在我们就可以添加原子了。 从菜单栏中选择Build | Add Atoms。通过它,我们可以把原子添加到指定的位置,其对话框如下: 在Element文本框中键入As。在a, b, c文本框中键入0.25。按Add按钮。关闭对话框。 原子添加完毕,我们再使用对称操作工具来构建晶体结构当中剩余的原子。这些原子也显示在邻近的单胞中。当然,我们也可以通过重新建造晶体结构来移去这些原子。 从菜单栏中选择Build | Crystals | Rebuild Crystal...,按下Rebuild按钮。在显示出的晶体结构中那些原子就被移走了。我们可以把显示方式变为Ball and Stick。 在模型文档中右键单击,选择Display Styles,按下Ball and stick按钮。关闭对话框。 在3D视窗中的晶体结构是传统的单胞,它显示的是格子的立方对称。如果存在的话,CASTEP使用的则是格子的全部对称. 既包含有两个原子的原胞和包含有8个原子的单胞是相对应的.不论单胞如何定义,电荷密度,键长,每一类原子的总体能量都是一样的,并且由于使用了较少的原子 ,使计算时间得以减少。 CO吸附在Pd(110)面 目的:介绍用CASTEP如何计算表面上的吸附能。 5.释放Pd(110)面 现在我们最优化Pd (110)表面。 在Project Explorer的Pd (110)文件夹中打开Pd(110).xsd。从工具栏中选中CASTEP 工具,然后选择Calculation。按下More...按钮,确定Optimize Cell没有被选中。关闭对话框。 为了维持我们想要完成的计算的连贯性,我们应该更改Electronic标签中的一些设置。 选择Electronic tab标签,然后按下More...按钮。从CASTEP Electronic Options对话框中选择Basis标签,勾选上Use custom energy cut-off并且把域植从260.0改为300.0。选择k-points标签,勾选上Custom grid参数。在Grid parameters域中,把a改到3,b改到4,c改到1。关闭对话框。 我们还应该计算此体系的态密度。 选择CASTEP Calculation对话框中的Properties标签,选中Density of states。勾选上Calculate PDOS,把k-point set改为Medium。 按下Run按钮,关闭对话框。 计算的运行会耗费一定的时间,我们可以最后做分析。我们现在 可以构建下一组表面。 从菜单栏中选择File | Save Project,然后选择Window | Close All。 6.添加CO到1x1Pd(110),优化此结构 我们要使用在(1x1) Co on Pd(110)文件中的结构来进行下面的工作。 在Project Explorer中,打开(1x1) Co on Pd(110)文件中的(1x1) CO on Pd(110).xsd。 现在在short bridge position上添
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