使用核磁共振光谱决定化学结构的另一选择.docVIP

使用核磁共振光譜決定化學結構的另一選擇 ──碳序法之化學結構決定 陳勝智 中國醫藥學院 藥物化學研究所 摘要： 本文介紹利用核磁共振光譜，如何進行碳碳連結產生化學結構的方法。本法將碳譜與氫譜之各訊號分別由低磁場到高磁場，一一標識序號。根據HMQC，由氫之序號找到碳之序號，將COSY的氫氫偶合相關改為碳碳連結，也將HMBC碳氫遠程偶合相關更改為碳碳遠程連結，最後利用此等連結進行碳碳連結產生化學結構。化學結構建構完成時，核磁共振光譜訊號之歸屬也一起完成。 關鍵字：化學結構決定，碳序法，核磁共振光譜。 （本文已發表於化學 60, 153-162, 2002） 前言 核磁共振光譜能提供豐富的化學結構的相關訊息，故在化學結構決定上扮演著很重要的角色。一般，於取得核磁共振光譜後，從譜型或特性訊號之化學位移、偶合常數等，判斷此等資料與化合物之化學結構的關係，並進一步進行歸屬（assignment），確定化合物的化學結構。當然此過程中，還會尋求二維光譜的協助尋找相關（correlation）以及連結（connection）1。換言之，讀譜作業與光譜之使用是一般所熟悉的方法。 筆者經由國內軟體公司的介紹，由Spectrum Research, LLT之網站（）下載SpecMan及NMR-SAMS兩套試用版軟體。此二軟體可直接由核磁共振光譜儀之電腦檔案選取光譜訊號資料（peak picking），並產生化合物的化學結構。簡言之，他們是產生化學結構用的簡便軟體。但經過三十天的試用後發現，此二軟體還需要有解讀核磁共振光譜能力的專家協助使用，因二者在選取光譜資料時，需要專家修正他所處理的資料。筆者認為，既然是有經驗者才能使用，已失去選用此二軟體的意義。筆者從其處理資料的過程以及原創者文獻2-5，體會到該軟體是以碳為主體來建構化學結構式，其法可以理解，但後半部因自動化的需求或軟體選取訊號的正確性問題，並且未好好利用HMBC的所有資料，降低產生化學結構的成功機會。筆者認為電腦自動選取資料，速度雖快，但若還需要專家修正，不如一開始就靠「人腦」做正確且合理的選取訊號，並好好利用HMBC的所有資料做正確的連結，以獲得正確的結果。於是，筆者反覆嘗試並建立以碳為主體，進行碳碳連結產生化學結構式的人為方法，做為使用核磁共振光譜的另一選擇。本法雖較電腦費力，但所費時間不多，卻因隨機應變或因「地」制宜的作業過程，使結果較為可靠，值得採用。 本法先將碳譜的各訊號以阿拉伯數字，由低磁場到高磁場標識序號（ID number）；氫譜也以相同方式標識序號。根據HMQC，由氫之序號找到碳序號，將COSY的氫氫偶合相關改為碳碳連結，也將HMBC之碳氫遠程偶合相關更改為碳碳遠程連結，最後進行碳碳連結產生化學結構。在本法的操作過程中，COSY直接提供明確的碳碳連結，HMBC所提供的碳碳連結是α位與β位的遠程連結，比較複雜，但因HMBC資料的定位（allocation）效果，每一個碳均有一定的位置，以類似拼字或拼圖遊戲（crossword or jigsaw puzzle）的反覆嘗試即可產生化學結構。化學結構建構完成時，核磁共振光譜訊號之歸屬也一起完成。結構產生的過程是碳碳連結的過程，其功能類似INADEQUATE光譜。 本文以brucine為例，敘述本法之化學結構產生過程與結果，同時也提供經驗與建議。 光譜之測定 本實驗取購自默克公司之brucine 20 mg 溶於0.6毫升CDCl3 中，以300MHz核磁共振光譜儀（Bruker ARX-300）分別測定氫譜、碳譜、DEPT、COSY、HMQC、HMBC等光譜。以上光譜均以內建程式測定，其參數未做特別更改。 結果 本文以brucine為例，故於獲得brucine的各種光譜之後，使用微軟的Words文書軟體，依下述順序作業來產生brucine之化學結構。採用微軟的Words文書軟體的理由是此軟體相當普遍，且此軟體的上標、下標、文字之著色、表格之網底、欄寬的調整等都很方便。 光譜資料表格化 表一顯示碳譜、氫譜、DEPT、HMQC、COSY、HMBC等光譜資料表格化的結果。ID欄中的號碼用來代表碳的序號，此號碼將標記於碳原子之右上角做為識別之用。因ID欄的序號由上而下已依序排定，第二欄中的資料是碳譜的化學位移，由低到高磁場，由上而下，數字由大而小逐漸遞減。為避免兩組號碼混淆，氫之序號均冠以#來與碳之序號區別。第三欄的DEPT是依DEPT光譜資料，將該號的碳以一至四級碳表達出來，例如第8及9號碳是三級碳以CH填表，第23號碳是二級碳以CH2填表。比較特別的碳，如2至9號碳是不飽和碳，可以灰色網底區分，以提醒其共通性。第四欄利用HMQC之交叉峰（cross peak），填上碳所接的氫原子訊號之序號。換言之