06_蛋白质序列比对与分子进化分析_2014-2.pptxVIP

Chapter 6 Analysis of Sequence Alignment and Molecular Evolution of Proteins —— Part Two 6.2 多重蛋白质序列比对 多重序列比对是分子生物学领域中一种十分重要的分析方法，可用于发现特征性序列，进行蛋白质分类，证明序列间的同源性，预测新序列的二级与三级结构，以及进行分子进化分析。 BLAST程序提供的算法主要适用于揭示两条序列之间的匹配情况，如果要将两条以上的序列进行比对，则需要采用新的算法。 目前用于多重序列比对的程序主要是ClustalW（Windows版本为ClustalX）和Multalin。 这里仅介绍ClustalW的使用方法（本机）。 ClustalX最新Windows版本的下载地址： ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/software/clustalw2/2.1/clustalx-2.1-win.msi 6.2.1 ClustalX软件的使用 双击“clustalx-2.1-win.msi”运行安装程序。 (1) ClustalX的安装和运行 运行ClustalX程序。 ClustalX程序提供“Multiple Alignment Mode”和“Profile Alignment Mode”两种比对模式。 (2) 比对模式的选择 Multiple Align