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EMSA

EMSA总步骤 一、核蛋白的提取: 准备物品: 蔗糖、Tris、KCl、NaCl、EDTA、EGTA、DTT、glycerol、spermidine、PMSF、leupeptin、pepstatin、aprotinin、benzamidine、NaF、Na3VO4均购自sigma公司。透析管(Slide-A-Lyzer?,10,000 MWCO)购自PIERCE公司。Dounce(tight)匀浆器购自Wheaton公司。 终浓度和分子量 作用 储存位置状态 配制注意事项 spermidine 0.5 mM FW 145.2 在任何pH值都带正电,使膜、核酸结构稳定。 DTT 1mM FW 154.3 Reductant of other disulfides. PMSF 0.5mM MW 174.2 Inhibitor of serine proteases and acetylcholinesterase,such as chymotrypsin, trypsin, thrombin and thiol proteases such as papain. leupeptin 20μg/ml FW 475.6 Reversible competitive inhibitor of serine and thiol proteases.Reported to inhibit calpain, cathepsin B, cathepsins H and L and trypsin. pepstain 0.76μg/ml FW 685.9 inhibitor of acid proteases (aspartyl peptidases). aprotinin 2μM FW 6500 Competitive serine protease inhibitor. Benzamidine ? 1mM FW 156.6 Reversible inhibitor of trypsin, trypsin-like enzymes, and serine proteases. NaF 50mM MW 41.99 Inhibitor of serine/threonine phosphatases. Na3VO4 1mM MW 183.91 Inhibits ATPase, alkaline phosphatase and tyrosine phosphatase. 3. Buffer C 20mM HEPES pH7.9、25% glycerol、1.5mM MgCl2、1mM EDTA pH8.0 Filter sterilize stock solution 使用前加入以下浓度的试剂: 名称 终浓度 DTT 1mM PMSF 0.5mM leupeptin 20μg/ml pepstain 0.76μg/ml aprotinin 10μM Benzamidine 1mM NaF 50mM Na3VO4 1mM 4. Dialysis Buffer 10mM Tris pH7.9、10% glycerol、5mM MgCl2、50mM KCl、1mM EDTA pH8.0 Filter sterilize stock solution 使用前加入以下浓度的试剂: 名称 终浓度 DTT 1mM PMSF 1mM Benzamidine 1mM NaF 50mM Na3VO4 1mM 具体步骤: 1. 冰上吸去细胞培养基; 2. 加入冷的PBS 10ml/10cm plate。 3. 吸去PBS, 加HB 1ml/10cm plate, 冰上静置10min, 刮下细胞至1.5ml EP管。 4. 3000rpm, 4℃, 5min。 5. 弃上清,0.25ml HB 重悬离心下来的细胞,将各相同处理组合并至 1ml/管,因为此实验中使用的匀浆器每次的容量为 1ml, 所以为了方便重悬细胞的HB的体积可稍有变动。 6. 使用匀浆器(Dounce Homogenizer-紧)匀化细胞,每个处理为 1ml, 匀浆15次。 7. 将细胞匀浆转移至另一1.5ml EP管。 8. 分离细胞核:14000g, 4℃, 15sec (指达到最高速度后的时间),弃上清 。 9. 解离转录因子:用约20μl Buffer C 重悬离心下来的细胞核,用手指轻弹EP管底部 混匀 ,然后加入约20μl 1M KCl-用手指轻弹EP管底部 混匀 。Buffer C与1M KCl的总量应与细胞核的体积相同,Buffer C :1M KCl =

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