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SDSPAGE凝胶电泳2
同济大学 周智敏 SDS凝胶电泳 实验原理 实验步骤 注意事项 SDS的优点 SDS的缺点 实验常见问题及处理 小技巧 实验步骤 1.试剂配制 1 30%丙烯酰胺(Acr):称Acr30g,甲叉双丙烯酰胺(Bis)0.8g,加蒸馏水至100ml,过滤后置棕色瓶中。 4℃,1~2月(2)10%SDS(十二烷基磺酸钠)(3)1.5mol/L Tris-HCl缓冲液 pH8.8 : 称取Tris 18.2g, 加入50ml水,用1mol/L盐酸调pH8.8,最后用蒸馏水定容至100ml。 (4)1.0mol/LTris-HCl缓冲液 pH6.8 : 称取Tris12.1g,加入50ml水,用1mol/L盐酸调pH6.8,最后用蒸馏水定容至100ml (5)0.05mol/LTris-HCl缓冲液 pH8.0 :称取Tris0.6g,加入50ml水,用1mol/L盐酸调pH8.0,最后用蒸馏水定容至100ml (6)TEMED(四甲基乙二胺) (7)样品溶解液: SDS(100mg)+巯基乙醇(0.1ml)+ 溴酚蓝(2mg)+甘油(2g)+ 0.05mol/L pH8.0Tris-HCl(2ml),最后定容至10ml (8)固定液:50%甲醇454ml,冰乙酸46ml混匀 (9)染色液:称取考马斯亮蓝R250 0.125g,加上述固定液250ml,过滤后备用 (10)脱色液: 冰乙酸75ml,甲醇50ml,加蒸馏水定容至1000ml (11)电极缓冲液 (内含0.1%SDS,0.05mol/LTris- 0.384mol/L甘氨酸缓冲液pH8.3):称Tris6.0g,甘氨酸28.8g,加入SDS1g,加蒸馏水使其溶解后定容至1000ml 2. 聚胶前准备 1 配制10%过硫酸铵溶液 需每天新鲜配制 。 2 将单体储存液、缓冲液、水按照一定比例配制成凝胶溶液。 3 将灌胶装置准备好。 4 待凝胶溶液平衡至室温 23~25℃ 后,真空脱气15 min。 3.不连续系统下层分离胶的聚合 在10 ml凝胶溶液中加入10%过硫酸铵50 μl 最终浓度为0.05% ,TEMED原液5μl 最终浓度为0.05% 。轻缓地摇动溶液 8~10下 ,使激活剂混合均匀。 将凝胶溶液平稳地注入两层玻璃板中 注意要以连续平稳的液流从中间位置注入 ,再在液面上小心注入一层水或正丁醇 约2~3mm高 ,以阻止氧气进入凝胶溶液中,然后静置至少90 min。 4.不连续系统中的上层浓缩胶 和连续系统凝胶的聚合 连续系统只含一种凝胶,它和不连续系统中的浓缩胶具有相同之处,即在其液面处与空气相接触,因此激活剂的含量应相应地增加,在10m1凝胶溶液中加入10%过硫酸铵50 μl 最终浓度0.05% ,TEMED原液10 μl 最终浓度0.1% 。 同前将激活剂混合均匀,但摇动溶液时不要摇得过于剧烈以免引入过多的氧气。 吸去不连续系统中下层分离胶上的水分,以连续平稳的液流注入凝胶溶液,然后小心插入梳子并注意不得在齿尖留有气泡。 静置90 min以上以保证完全聚合。 如果在聚胶过程中发现一道道纹线,即凝胶不均匀,可能是聚合速度太快或激活剂未充分混合导致局部浓度过高。 凝胶聚合的速度可以通过紫外吸收检测,由于丙烯酰胺中的双键在260nm有吸收,聚合后双键消失,光吸收减低。将凝胶溶液倒入石英比色杯中,可观察到20~30 min后光吸收读数开始下降,至80 min以后趋于稳定,说明聚合完成。 5.电泳 将聚合好的凝胶板安置于电泳槽中,上样,选择适当的电压进行电泳。 6.染色和脱色 电泳完毕需通过染色和脱色评定其结果的优劣,此外根据不同的研究目的,也可将凝胶直接进行放射自显影及电印迹。 7.结果处理 测量并计算分子量 蛋白质的分子量与它的电泳迁移有一定关系式,经37种蛋白的测定得到以下的关系式 Mw = K 10-bm 1 lgMw lgK-bm K1-bm 2 其中MW是蛋白质分子量;K和K1为常数 b为斜率,m是电泳迁移率,实际使用的是相对迁移率mR。 mR dpr/dBPB 实验注意事项 1. 形成凝胶的试剂要有足够的纯度:丙烯酰胺是形成凝胶溶液中的最主要成份,其纯度的好坏将直接影响凝胶的质量,丙烯酰胺可能混有的影响凝胶形成的杂质有:丙烯酰胺、线性多聚丙烯酰胺、金属离子等。 2. 注意不能随便倾倒单体溶液,应加入过量的催化剂使其完全聚合成无毒性的聚丙烯酰胺后再弃置。 3. TEMED中混有氧化试剂后其自身极易被氧化而失去催化能力,另外TEMED的氧化产物呈黄色,以此可以鉴定TEMED的质量。如果无法获得无色透明的TEMED,只能适当增加用量以保证聚胶速度。 4. 过硫酸铵容易吸潮,由于它溶解于水后很快降解失
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