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第九章  微生物的分类、鉴定 Taxonomy、Identification 微生物分类鉴定目的 分类是人类认识微生物，进而利用和改造微生物的一种手段，微生物工作者只有在掌握了分类学知识的基础上，才能对纷繁的微生物类群有一清晰的轮廊，了解其亲缘关系与演化关系，为人类开发利用微生物资源提供依据。 第一节 微 生 物 分 类 学微生物分类学(Taxonomy) 是一门按微生物类群的亲缘关系把它们安排成条理清楚的各种分类单元或分类群（Taxon）的科学 分类学的任务 分类（Classification）：是指根据相似性或亲缘关系，将一个生命有机体放在一个单元中  命名（Nomenclature）：是按照国际命名法规给予生命有机体一个科学的名称  鉴定（Identification）：是指确定一个新分离物是否归属于某个已命名的分类单元的过程。 一、微生物的分类单位（单元） 界（Kingdom） 门（Phylum or Division） 纲（Class） 目（Order） 科（Family） 属（Genus） 种（Species） 种是最基本的分类单位。 但分类单元之间可加入亚门、亚纲、亚目、亚科等次要分类单位。种以下又可分为亚种、变种、型、菌株等 微生物种与亚种的概念 种(Species) ：难下定义，无公认的 凡是于典型培养菌紧密相同的其他培养菌统一起来，区分为细菌的一个种（Species），即是以某个“典型菌株”为代表、十分类似的、与同属的其它物种有着明显差异的一大群菌株的总称。1987年，国际细菌分类委员会颁布，DNA同源≧ 70%，而且其Tm≦5oC的菌群为一个种 典型菌株（模式种）：在微生物中作为一个种的典型、具体代表的菌株。 在微生物中，种还是一个抽象的概念，具有该种的许多典型性状的模式菌株才是具体的种。 亚种（Subspecies) 在种内，有些菌株在遗传学上关系密切，而且在表型上仅存在较小的某些差异，在种内分成2个或2个以上的分类单位，即为亚种 微生物亚种以下的变型分类 亚种以下 生物变型——表示特殊的生化或生理特征 血清变型——表示抗原结构不同 致病变型——表示某些寄主的专一致病性 噬菌变型——表示对噬菌体的特异性反应 形态变型——表示特殊的形态特征 微 生 物 的 菌 株 菌株(Strain)或称品系 是指同种微生物不同来源的纯培养物即单个分离物的纯培养后代，常以数字、字母、人名或地名等表示 一种微生物的每一不同来源的纯培养物或纯分离物均可称为菌种的一个菌株。 （1）菌株数目几乎是无数的 （2）是遗传型纯的谱系 （3）同一菌种的不同菌株间，主要性状相同，其他次要性状可能相差较大 （4）菌株变异应表以新的菌株 （5）实际应用菌种时都要在种的后面标出该菌株的名称 分离物是指已分离得到但未经鉴定的纯培养物的后代即为分离物 群(Group) 为工作方便而将近似的种或介于种间的菌株按其形态或结合生理生化、生态特征归为若干类群。如放线菌中的链霉菌属内的种归为12个类群 二、微 生 物 的 命 名1 微生物名称有俗名（地区性）和学名（科学） 微生物的命名按国际命名法命名，即Linna所创立的“双名法” 每一种微生物都用属与种命名，由2个拉丁词或希腊词或拉丁化了的其他文字组成。属名和种名用斜体表达 属名在前，用拉丁名词表示微生物的构造、形态、某科学家名字等，描述微生物的主要特征。第一字母大写 种名在后，第一字母小写。用拉丁形容词表示，描述微生物的色素、形状、来源、病名、地名、某科学家的名字等等 在种名后，附上首次命名者的姓、现名定名人和命名年份 （正体），可省略。 Bacillus subtilis（Ehrenberg） Cohn 1872 微 生 物 的 命 名2 如命名对象是新种，需在种名后加sp.nov 或nov.sp(即nova species) 如仅泛指某一属的微生物，或某属微生物内的某些