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第四章 DNA的损伤修复
DNA损伤的种类1. 碱基的脱落2. 碱基(或核苷)的改变3. 错误碱基掺入4. 核苷酸的缺失或插入5. 嘧啶碱基的二聚体6. 链的断裂7. DNA链的交联 甲基化过程 甲基化指导的错配修复过程 嘧啶二聚体的产生 光复活 uvrABC核酸酶的作用机制 重组修复(Recombination Repair) 一 限制-修饰现象 二 限制-修饰系统 三 限制修饰系统的生物学意义 细菌中三种不同类型的修饰-限制酶 1 防止外源DNA的入侵及对外源DNA的利用; 2 对自身DNA的保护; 3 Ⅱ类酶广泛应用于DNA重组技术。 5' GTT AAC 3' Hpa Ⅰ blunt end 3' CAA TTG 5' 5' G↓AATTC 3' EcoRⅠ 5’protruding end 3' CTTAA↑G 5' 5' A↓AGCTT 3' HindⅢ 5’protruding end 3' TTCGA↑A 5' 5' G↓GATCC 3' BamHⅠ 5’protruding end 3' CCTAG↑G 5' 5' C↓TGCAG 3' PstⅠ 3’protruding end 3' GACGT↑C 5' * * 第三章 DNA损伤修复 复制修复系统: 损伤修复系统: 限制修饰系统 修复机制 错配修复 光复活,碱基切除修复, 重组修复, SOS修复 错配修复——通过一个酶系统修复正 在复制的DNA链中的错配碱基 母链的识别? 根据复制叉上DNA甲基化程度,切除尚未甲基化的子代链上的错配碱基. 校对活性? 错配修复的甲基化依赖机制 ?Dam甲基化酶,使位于5’GATC序列中A的N6位甲基化,使母链在复制前被甲基化,作为子链修正的依据。 ?当子链中有错配碱基时,修复系统在母链甲基化腺苷酸的上游鸟苷酸5’位置切开子链并在切口处启动修复合成子链。 甲基化部位 5’ 切割部位 p.52 嘧啶二聚体 的修复机制 光复活 切除修复 重组修复 SOS修复 光复活 photoreactivation :DNA的直接修复(Direct repair)方式。 光解酶(Photolyases)利用吸收光产生的能量使嘧啶二聚体转为单体 切除修复: 一)碱基切除修复(Base Excision Repair BER) 相关概念: Ap位点:糖苷水解酶识别受损核苷酸(C U) , 并特异性的切除核苷酸上的碱基,该 位点为缺失碱基的位点,即AP位点。 Ap内切酶的作用: Ap内切酶切开受损伤的核 苷酸的磷酸二酯键,切除包括该 Ap 位点在内的一小段DNA. 1. DNA糖苷消解酶(glycosylase)识别损伤碱基并特异性切除受损DNA上的N- ?-糖苷键,从而形成去除碱基位点(AP位点); 2. Ap内切酶切开Ap位点附近的磷酸二酯键,除去包括Ap位点的一小段DNA; 3. DNA Pol l 除去DNA链的损伤部分(5’--3’外切)并合成新链; 4. 连接酶封闭。 碱基切除修复过程: 二)核苷酸切除修复 (Nucleotide Excision Repair,NER) ? 核苷酸切除修复系统的作用包括DNA切割酶、DNA聚合酶、DNA连接酶等系统的作用。 ? DNA切割酶能在已损伤的DNA核苷酸的5’和3’位分别切开磷酸二酯键,产生两个切口。 ? uvrABC核酸酶切下含有损伤部位的一段DNA片段,DNA PolI填补缺口,连接酶封闭切口。 核苷酸的切除修复过程 原核生物切下12-13个核苷酸(8+4),真核生物切下27~29个核苷酸(22+6) 不能去掉错误,但是能够无限制的稀释 SOS修复 (SOS Repair):损伤DNA诱导了一种错误倾向复制系统。 在这种复制系统中校阅功能降低,以致产生更多差错,影响复制真实性,其结果突变增加但免于死亡,这种修复也称错误倾向修复(Error-Prone Repair) SOS修复是一种应急
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