第二章第二节 基因克隆的载体课件.ppt

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二 噬菌体载体 (phage vectors) 1、?噬菌体的生物学特性 2、 ?噬菌体载体 3、M13噬菌体的生物学特性 4、M13噬菌体载体 4. M13噬菌体载体 后表现不稳定,在噬菌体增殖过程中容易发生缺失。所以一般克隆的片段在1kb之内,克隆300-400bp的片段十分稳定。 载体中含有LacZ基因及位于其中的多克隆位点,所以能通过?互补在X-Gal/ IPTG平板上识别重组体。这类载体包括了 M13mp8、9 和 M13mp18 、 19等。 这类载体的突出优点在于其既可以提供单链DNA,也可以提供双链的DNA。其最大的不足在于插入大的DNA片段 第二节 基因克隆的载体 引 言(introduction) 一 质粒载体(plasimid vectors) 二 噬菌体载体(phage vectors) 三 柯斯质粒载体(cosmid vectors) 三 柯斯质粒载体(cosmid vectors) 柯斯质粒载体的特点 柯斯质粒是一类人工构建的含有?DNA的cos序列和质粒复制子的特殊类型的质粒载体,cosmid是cos site carrying plasmid的缩写。 柯斯质粒的大小为4-6kb, 由3部分组成: A.多克隆位点区 B. 含有cos位点的?DNA区 C. 复制起始位点和抗性标记区 pHC79 Ori Marker MCS cos ?DNA 三 柯斯质粒载体(cosmid vectors) 柯斯质粒载体的特点 1、具有?噬菌体的特性 柯斯质粒连接上适宜长度的外源DNA后可以在体外包装成噬菌体颗粒,并能高效转导寄主细胞。进入寄主细胞的DNA也能环化和复制,但是不会形成新的噬菌体颗粒,也不能发生溶菌现象。 2、具有质粒载体的特性 能象质粒一样在寄主细胞内复制,且带有抗性选择标记基因,有些还带有插入失活型的多克隆位点,为重组体的筛选提供了方便。 3、高容量的克隆能力 cos质粒本身很小,只有复制起点、选择标记和cos位点等构成,所以其克隆上限可达45kb左右。不过由于包装的限制,其克隆片段至少要达到30kb。 三 柯斯质粒载体(cosmid vectors) 柯斯质粒载体的应用 ?噬菌体的位点特异切割体系——末端酶(terminase)体系要求两个cos位点间要保持38-54kb的距离。 下面的操作中缺点是:cosmid自我重组、外源DNA片段串联 后重组。 Ori Marker MCS cos ?DNA 三 柯斯质粒载体(cosmid vectors) 柯斯质粒载体的应用 1981年,Ish-Horowics和Burke设计了一种特殊的克隆方案,在所用的质粒上的BamHI位点的两侧各有一个EcoRI位点包围着。这样在BamHI位点克隆的DNA片段可以用EcoRI重新切割下来。 cos HindIII BamHI Sal I Sal I HindIII 磷酸化酶 Sal I BamHI BamHI HindIII BamHI BamHI Sal I HindIII Sau 3A 磷酸 化酶 32-47 kb 小 结 第二节 基因克隆的载体 引 言(introduction) 一 质粒载体(plasimid vectors) 二 噬菌体载体(phage vectors) 三 柯斯质粒载体(cosmid vectors) 基因工程的基本步骤 基因分离酶切 载体酶切 基因和载体连接 导入细菌 重组质粒繁殖 重组克隆的选择 序列分析和基因表达等研究 导入植物细胞 ③EDTA Mg2+、Ca 2+的螯合剂,可抑制DNA酶的活性,防止DNA被酶降解。 ④NaOH-SDS NaOH:强碱,提供pH12的碱性条件,使DNA双链变性。 SDS: 溶解细胞膜蛋白和细胞内蛋白,并结合成“蛋白—SDS”复合物,使蛋白质(包括DNA酶)变性沉淀。 用冰醋酸将醋酸钠溶液的pH调到4.8。 用来中和NaOH变性液,使DNA复性。 高浓度的NaAc有利于变性的大分子(蛋白质、DNA、RNA等)沉淀。 用于沉淀DNA。 ⑥ 乙醇 DNA分子以水合状态“溶于”水里,乙醇能夺去DNA分子的水环境。 ⑤ NaAc-HAc缓冲液 ⑦ RNase A 降解RNA渣滓。 以免提取后的DNA中含有小分子的RNA。 ⑧ TE缓冲液 DNA保存液。 由Tris-HCl和EDTA配制。 Tris-HCl不含金属离子(不同于磷酸缓冲液或硼酸缓冲液),有利

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