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R软件画图常用函数及参数.
R的基本画图函数非常容易学,看上去也很普通。然而适当的参数设置,有意义的颜色设置,不同基本图间的互相组合,会使你的图更漂亮也更有力的表达数据。下面介绍一些R基本包里画图函数的参数: hist(): breaks设置每个柱的间距;freq柱图表示count或frequency;polt设置是否画图;density和angle可以设置柱上的斜线;axes设置是否需要画坐标轴; cor设置柱图的颜色;border设置柱图边界的颜色;xlim设置横轴范围;ylim设置纵轴范围。 R的许多函数都有类似的参数名,这些函数往往有同样的功能。因此后面就只介绍比较特殊的参数。 layout():mat用矩阵设置窗口的划分,矩阵的0元素表示该位置不画图,非0元素必须包括从1开始的连续的整数值,比如:1……N,按非0元素的大小设置图形的顺序。widths用来设置窗口不同列的宽度,heights设置不同行的高度。par()的mfcol,和mfrow参数也有类似layout的功能,不过相对layout就逊色多了。 par():mar设置图离四个边缘的距离;bg设置背景颜色;xaxt和yaxt设置坐标轴标签的类型(=”n”表示不画轴标签);xlim和ylim设置坐标轴的范围。 axis():las设置坐标轴标签的方式(水平,垂直……)。 mtext():为四个坐标轴添加标签。 text():在给定坐标的位置写字。 lines():lty设置线的类型;lwd设置线的宽度。 points():pch设置点的类型。 plot():最简单的画图函数。type设置画图的类型(type=”n”表示不画数据);axes设置是否画坐标轴。常用的参数还有:xlim和ylim,xaxt和yaxt。 barplot():space设置bar图间的间距;horiz设置bar的方向是垂直或水平;beside设置height为矩阵时,每列元素的bar排列方式;add设置是否将barplot加在当前已有的图上。 legend():除了利用x,y设置图例的坐标外,用”topleft”, center,bottomright等设置位置非常方便。ncol设置图例的列数, horiz设置图例的排列方向。常有的参数还有col,lty,pch。 heatmap():Rowv和Colv设置是否需要按行或列聚类;scale设置是否需要按行或列标准化;na.rm设置是否移去NA;RowSideColors和ColSideColors可以在行或列边缘添加颜色;keep.dendro设置是否画聚类树。 dendrogram():nodePar和edgePar都是list,可以方便的设置节点和边的各种属性,如:颜色,样式,宽度,标签……。 在初学一个函数的时候,可能不知道函数有哪些参数,尤其是R中用...省略的参数。这时候看看“See Also:”里面提供的相关函数时非常有用的,R函数多是继承其它的更一半的函数,所以参数也会继承,理解了这一点,就能灵活应用..省略的参数了。另一方面,一些函数返回的对象的类是比较复杂的,有多个属性(一般会在“Value”里面说明这些对象的属性)。但有些函数的帮助里没有“Value”栏, 幸运的是R中的一些函数提供了对各种类通用的处理,通过这些函数你可以大概了解一个对象所有的属性。如:summary()总结对象的基本特征;attributes()列出对象的所有属性;attr()给出对象的指定属性的值;labels()列出对象的标签;str()展示对象的结构……。 学会使用这些函数和参数能让你的图更好看,但是理解R的函数结构和参数意义,会更有意义。正所谓,受之与鱼不如受之与渔。
3.1 par()函数的参数详解
函数par()可以用来设置或者获取图形参数,par()本身(括号中不写任何参数)返回当前的图形参数设置(一个list);若要设置图形参数,则可用par(tag = value)的形式,其中tag的详细说明参见下面的列表,value就是参数值,例如:
1 # 设置边距参数和背景色
2 par(mar = c(4, 4, 1, 0.5), bg = yellow)
目前par()函数涉及到的图形参数大约有70个,这里只是选取其中40多个常用且较易理解的参数进行解释说明如下列表,其它参数请参阅R帮助?par。
adj 调整图中字符的相对位置;取值:长度为2的数值向量,分别表示字符
边界矩形框的左下角相对坐标点(x, y)位置的调整,向量的两个数值一般都在[0; 1]范围中(有些图形设备中也可以超出此范围),表示字符串以左下角为基准、根据自身的宽度和高度分别向左和向下移动的比例,默认为c(0.5, 0.5)。例如c(0, 0)表示整个字
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