第三章蛋白质与蛋白质组学--精.pptVIP

第三章　蛋白质与蛋白质组学 第一节 蛋白质的分子结构 (一) 一级结构:蛋白质分子中氨基酸的排列顺序称为蛋白质的一级结构，包括二硫键的位置 （二）二级结构： 概念：是指多肽链中主链的局部构象，不涉及氨基酸侧链在主链上的空间排布。 种类：1. α螺旋 2. β折叠 3. β转角 4. 无规则卷曲 5. 超二级结构 是多肽链内相互邻近的几个二级结构单元在空间上进一步靠近、相互作用形成的规则的二级结构聚集体，称为超二级结构 （三）三级结构：具有二级结构的一条多肽链，由于氨基酸侧链的相互作用，进一步卷曲折叠，形成蛋白质的三级结构，它包括这条多肽链中所有原子的空间排布 结构域 结构域 （四）四级结构：某些蛋白质由两条或多条肽链组成，每条肽链都具有完整的三级结构，称为该蛋白质的一个亚基。亚基之间通过非共价键结合，形成特定的空间结构，称为该蛋白质的四级结构。 第二节 蛋白质的结构与功能的关系 一、一级结构与蛋白质功能的关系 蛋白质的一级结构决定其空间结构，进而决定其生物学功能。 （一）一级结构是构象的基础 核糖核酸酶由124个氨基酸残基组成，其中有8个是半胱氨酸残基，它们在分子内形成4个二硫键 核糖核酸酶一级结构 （二）一级结构变异可直接影响其功能 基因突变可改变蛋白质的一级结构，使蛋白质生物活性降低或丧失，甚至改变生理功能，而发生疾病。镰状细胞病是由血红蛋白分子结构异常变而引起的分子病 二、蛋白质的空间结构与功能的关系 蛋白质的空间结构直接决定蛋白质的功能，决定功能蛋白的生物活性。生物体内的很多蛋白质就是在不改变一级结构的前体下，通过改变构象而改变活性，适应代谢需要。 ㈠蛋白质的变性 ㈡蛋白质的变构 酶的变构调节，血红蛋白 （三）辅助蛋白在蛋白质分子折叠中的作用 自组装学说:蛋白质一级结构是构象的基础。多肽链能自发的形成比较稳定的天然结构而具有生物学功能。 辅助组装学说：越来越多的研究发现，新生肽链折叠并组装成有活性的蛋白质的过程，在相当多的情况下需要其它辅助蛋白的帮助。 这类辅助蛋白包括蛋白伴侣和折叠酶。 ⒈蛋白伴侣　 概念：是细胞内参与其它多肽链或寡聚体折叠与组装的一类蛋白质，且在组装完毕后与之分离，并不是这些蛋白质的组成成分。 分布：蛋白伴侣从细菌到人类都广泛存在， 定位于细胞的各个场所。 种类：①分子伴侣：与未折叠或部分折叠的蛋白质结合并使其稳定，避免形成错误折叠、聚集或被降解。 ②伴侣蛋白：直接促进蛋白质折叠。  ⒉折叠酶类　某些蛋白质折叠的限速步骤是共价键的异构化，需要相应的酶催化。主要有肽基脯氨酰顺反异构酶（PPI）和蛋白质二硫键异构酶(PDI)。 PPI在细胞中的基本作用是改变脯氨酸残基形成的肽键的构型，以保证整个蛋白质分子形成正确的构象。 PDI的基本作用是催化巯基与二硫键的可逆反应，当多肽链中有许多半胱氨酸时，可能形成错误的二硫键，进而形成错误的蛋白质构象。PDI可以使错误连接的二硫键断裂，再形成正确的连接。在蛋白质折叠过程中，PDI主要催化含有二硫键的膜蛋白或分泌蛋白的正确折叠。 第三节　蛋白质组与蛋白质组学 基因 蛋白质 执行生命活动 基因组 蛋白质组 完成生命活动 基因组是稳定的，生物体所有不同细胞共享有同一个基因组，并且从机体的发生、发展到衰老、死亡基本稳定不变。 蛋白质组是一个动态的概念 一、概念: 蛋白质组:指一个基因组、一个细胞或组织或一种生物体所表达的全部蛋白质. “Proteome”是由蛋白质的”Prote”和基因组的“ome”字母拼接而成. 蛋白质组学: 在整体水平上研究细胞内全部蛋白质的组成及其活动规律的学科。 二、研究内容： 研究细胞内全部蛋白质的组成及其活动规律 分为两种类型： 一种是针对细胞或组织的全部蛋白质，也就是着眼点是整个蛋白质组； 一种是以与一个特定的生物学机制或机制相关的全部蛋白质为着眼点，着眼点在局部。 分支学科：功能蛋白质组学、表达蛋白质组学、肝脏蛋白质组学、神经蛋白质组学、亚细胞蛋白质组学、血浆蛋白质组学、糖蛋白质组学、疾病蛋白质组学、微生物蛋白质组学和药物蛋白质组学等。 三、研究方法： 现阶段蛋白质组的研究分为三个主要步骤 1.应用电泳、层析分离蛋白质（分离）。 2.应用aa组成分析、C和N末端aa序列分析、质谱分析鉴定所分离的蛋白质（鉴定）。 3.应用生物信息学数据库对鉴定结果进行储存、处理、