基因外显子的序列特征 基因外显子可以被分成三部分 能够被翻译成蛋白质的编码区 5?-非翻译区(5?UTR) 3?-非翻译区(3?UTR) 有作为蛋白质翻译起始重要元件的Kozak序列: 由起始密码子AUG及其周围序列组成 3?UTR位于终止密码子下游,含有poly A尾的加尾信号AATAAA序列 二)、基因编码序列的结构分析 基因的编码序列是指能体现在成熟mRNA中的核苷酸序列,因此,与mRNA互补的cDNA成为研究编码序列的主要切入点. 主要方法: cDNA文库的编码序列筛选 RNA剪接分析编码序列 用数据库分析编码序列 高通量分析RNA剪接的方法主要有三种: 基于DNA微点阵分析、交联免疫沉淀(CLIP)和体外报告基因测定法 对各种方法所获得的cDNA片段的序列在基因数据库中进行同源性比对, 通过染色体定位分析、内含子/外显子分析、ORF分析及表达谱分析等 四 基因拷贝数的分析 分析某种基因的种类及拷贝数,实质上就是对基因进行定性和定量分析,常用的技术包括DNA印迹(Southern印迹)、实时定量PCR技术等。 DNA印迹是根据探针信号出现的位置和次数判断基因的拷贝数。 实时定量PCR是通过被扩增基因在数量上的差异推测模板基因拷贝数的异同。 DNA测序是最精确的鉴定基因拷贝数的方法。 ??????????????????????????
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