桉树人工林根际土壤DNA提取的优化.docVIP

  1. 1、原创力文档(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。。
  2. 2、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载
  3. 3、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
  4. 4、该文档为VIP文档,如果想要下载,成为VIP会员后,下载免费。
  5. 5、成为VIP后,下载本文档将扣除1次下载权益。下载后,不支持退款、换文档。如有疑问请联系我们
  6. 6、成为VIP后,您将拥有八大权益,权益包括:VIP文档下载权益、阅读免打扰、文档格式转换、高级专利检索、专属身份标志、高级客服、多端互通、版权登记。
  7. 7、VIP文档为合作方或网友上传,每下载1次, 网站将根据用户上传文档的质量评分、类型等,对文档贡献者给予高额补贴、流量扶持。如果你也想贡献VIP文档。上传文档
查看更多
桉树人工林根际土壤DNA提取的优化.doc

桉树人工林根际土壤DNA提取的优化   摘要:通过优化土壤微生物总DNA的提取方法,获得高纯度、高得率和完整性好的总DNA,为桉树种植地土壤微生物群落多样性的分析奠定基础。综合比较已报道的土壤微生物DNA提取方法的优缺点,设计了7种从巨桉(Eucalyptus grandis Hill ex Maiden)人工林根际土壤中直接提取微生物DNA的方法,并通过PCR扩增、DGGE电泳及荧光定量PCR分析比较了不同方法所提取DNA的质量以及对后期分子生物学研究的适用性。结果表明,使用PVPP和硫酸铝铵联用吸附腐殖酸杂质后,采用PEG 8 000沉淀能够有效地提取桉树根际土壤DNA。该方法提取的DNA纯度最高,OD260 nm/OD230 nm达到2.45,OD260 nm/OD280 nm达到1.78,DNA得率为5.56 μg/g土壤,适用于PCR扩增和荧光定量分析,并且通过DGGE电泳分离出最丰富的条带,是一种高效的提取土壤微生物DNA方法。   关键词:桉树(Eucalyptus)人工林;根际;土壤;DNA提取;PCR扩增   中图分类号:Q781;Q939.96 文献标识码:A 文章编号:0439-8114(2016)12-3207-05   DOI:10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2016.12.053   Abstract: In order to obtain DNA with high purity, high yield and good integrity from the soil, for the analysis of the soil microbial diversity of Eucalyptus plantation, after comprehensive comparison of strengths and weaknesses of the commonly used methods for microbial DNA isolation,seven methods were designed to extract microbial DNA directly from the rhizosphere soil,and the different extraction methods were evaluated comprehensively for the DNA quality and applicability of the molecular biology by PCR, DGGE and RT-PCR. The results showed that during the improved high salt extraction procedures, PVPP and AlNH4(SO4)2 added in the DNA extraction buffer, and PEG 8 000 precipitation were required for the effective adsorption of humic acid impurities.The method gave the purest DNA with 2.45 at OD260 nm/OD230 nm and 1.78 at OD260 nm/OD280 nm, and the yield was appropriate with 5.56 μg/g DNA rhizosphere soil, which was suitable for PCR and RT-PCR, and the most abundant bands could be obtained by DGGE as well.   Key words: Eucalyptus plantation; rhizosphere; soil; DNA extraction; PCR amplification   土壤微生物是影响土壤生态过程的一个重要因素,在土壤形成与发育、土壤结构改良、肥力保持以及高等植物的生长等方面具有重要作用[1]。根际作为植物根和土壤的界面,定殖了大量的微生物和无脊椎动物,被认为是地球上最具动态的交界面[2]。在植物根系和土壤微生物相互作用的过程中,土壤微生物群落结构变化对根际微生态系统中养分活化、植物抗病性等方面都产生一系列影响[3]。近些年,关于林木根际土壤微生物的研究日趋增多,已在多个地区和多个树种上得到开展(茶树、落叶松、刺槐等)[4,5]。但目前关于桉树根际土壤微生物的研究仍以少量分离培养的方法为主[6,7]。桉树(Eucalyptus robusta Smi

您可能关注的文档

文档评论(0)

yingzhiguo + 关注
实名认证
文档贡献者

该用户很懒,什么也没介绍

版权声明书
用户编号:5243141323000000

1亿VIP精品文档

相关文档